Skip to main content
Ir a la página de inicio de la Comisión Europea (se abrirá en una nueva ventana)
español español
CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
CORDIS

Machine Learning-Assisted simulation of Metalloenzyme’s Reactivity

Descripción del proyecto

Métodos informáticos innovadores para esclarecer la reactividad de las metaloenzimas

Cerca de un tercio de todas las enzimas son metaloenzimas: proteínas que contienen un ion metálico como cofactor. Comprender sus mecanismos de acción es importante para campos como la medicina, la biotecnología, la catálisis y las ciencias ambientales. En este sentido, la modelización y la simulación constituyen herramientas excelentes para tal propósito. Sin embargo, los métodos informáticos actuales están concebidos para compuestos estrictamente orgánicos. También pueden ser adecuados en el caso de las metaloenzimas, pero requieren un gran tiempo de cálculo para simulaciones de dinámica molecular y estudios de reactividad. El proyecto MALAMER, que cuenta con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, tiene por objeto combinar campos de fuerza de aprendizaje automático, métodos híbridos de mecánica cuántica/mecánica molecular y técnicas avanzadas de muestreo para superar estas limitaciones. Los resultados contribuirán a esclarecer la reactividad de metaloenzimas y favorecerán el desarrollo de catalizadores y el descubrimiento de fármacos.

Objetivo

Metalloenzymes play a crucial role in various biological functions, going from small molecule transportation to catalyzing essential metabolic ingredients. Understanding their reactivity is essential for advancing a broad range of fields and related industries, such as medicine, biotechnology, environmental science, and catalysis. The computational modelling of biomolecules is a pillar of new drug and catalyst design, but the common methods used for purely organic-based compounds, such as empirical force fields, cannot simply be applied in the presence of a metal centre due to their complex electronic structure. On the other hand, hybrid Quantum Mechanical/Molecular Mechanics (QM/MM) methods provide a way to study metalloenzymes, but their computational overheads prevent their large-scale use for molecular dynamics simulations and reactivity studies. The project MAchine Learning-Assisted simulation of MEtalloenzyme’s Reactivity (MALAMER), aims to revolutionize the simulation of metalloenzymes' reactivity by integrating machine-learning force fields with QM/MM methods, and advanced sampling techniques, allowing for an unprecedentedly accurate description of their activity. This innovative approach will lead to significant insights and applications in catalyst development and drug discovery, with a potential impact on several EU priority areas. The project will commence in September 2024 under the supervision of Prof. Lunghi at Trinity College Dublin, with a planned 3-month secondment at University College London to gain additional expertise in advanced sampling simulations from Prof. Salvalaglio. A comprehensive set of training, dissemination, exploitation, and communication activities are planned and they will be implemented with the help of the supervisors and Trinity College Dublin's human resources, training office, and innovation and technology transfer office.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse

Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

THE PROVOST, FELLOWS, FOUNDATION SCHOLARS & THE OTHER MEMBERS OF BOARD, OF THE COLLEGE OF THE HOLY & UNDIVIDED TRINITY OF QUEEN ELIZABETH NEAR DUBLIN
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 199 694,40
Dirección
COLLEGE GREEN TRINITY COLLEGE
D02 CX56 Dublin
Irlanda

Ver en el mapa

Región
Ireland Eastern and Midland Dublin
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Socios (1)

Mi folleto 0 0