Descrizione del progetto
Metodi computazionali innovativi per chiarire la reattività dei metalloenzimi
Circa un terzo di tutti gli enzimi sono metalloenzimi, ovvero proteine dotate di cofattori di ioni metallici; la comprensione dei loro meccanismi d'azione è importante per campi quali la medicina, la biotecnologia, la catalisi e le scienze ambientali. La modellizzazione e la simulazione sono strumenti eccellenti a tal fine; ciononostante, sebbene gli attuali metodi computazionali siano progettati per composti strettamente organici o possano ospitare metalloenzimi, sono troppo pesanti dal punto di vista del calcolo per le simulazioni di dinamica molecolare e gli studi di reattività. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MALAMER si propone di integrare campi di forza ad apprendimento automatico, metodi ibridi di meccanica quantistica/molecolare e tecniche di campionamento avanzate al fine di superare queste sfide. I risultati generati dal progetto faranno luce sulle reattività, supportando lo sviluppo di catalizzatori e il processo di scoperta dei farmaci.
Obiettivo
Metalloenzymes play a crucial role in various biological functions, going from small molecule transportation to catalyzing essential metabolic ingredients. Understanding their reactivity is essential for advancing a broad range of fields and related industries, such as medicine, biotechnology, environmental science, and catalysis. The computational modelling of biomolecules is a pillar of new drug and catalyst design, but the common methods used for purely organic-based compounds, such as empirical force fields, cannot simply be applied in the presence of a metal centre due to their complex electronic structure. On the other hand, hybrid Quantum Mechanical/Molecular Mechanics (QM/MM) methods provide a way to study metalloenzymes, but their computational overheads prevent their large-scale use for molecular dynamics simulations and reactivity studies. The project MAchine Learning-Assisted simulation of MEtalloenzyme’s Reactivity (MALAMER), aims to revolutionize the simulation of metalloenzymes' reactivity by integrating machine-learning force fields with QM/MM methods, and advanced sampling techniques, allowing for an unprecedentedly accurate description of their activity. This innovative approach will lead to significant insights and applications in catalyst development and drug discovery, with a potential impact on several EU priority areas. The project will commence in September 2024 under the supervision of Prof. Lunghi at Trinity College Dublin, with a planned 3-month secondment at University College London to gain additional expertise in advanced sampling simulations from Prof. Salvalaglio. A comprehensive set of training, dissemination, exploitation, and communication activities are planned and they will be implemented with the help of the supervisors and Trinity College Dublin's human resources, training office, and innovation and technology transfer office.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
D02 CX56 Dublin
Irlanda
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.