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mRNA localization and spatial heterogeneity of translation: Deciphering the code within mRNP composition

Descrizione del progetto

Delineare il ruolo svolto dai complessi molecolari nello sviluppo

Le proteine leganti l’RNA (RBP, RNA binding protein) si assemblano con gli RNA messaggeri (mRNA, messenger RNA) per regolarne la stabilità, la localizzazione e la traduzione all’interno della cellula. Le particelle di ribonucleoproteine messaggere (mRNP, messenger ribonucleoprotein) generate svolgono un ruolo centrale nel controllo post-trascrizionale dell’espressione genica. Sono state identificate centinaia di RBP, il che suggerisce il verificarsi di assemblaggi di mRNP diversi per i vari mRNA. Finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto mRNPcode mira a delineare come la composizione delle mRNP influisca sul destino dell’mRNA. Il lavoro svolto nell’ambito del progetto, incentrato sulla differenziazione cellulare durante lo sviluppo, si avvarrà di embrioni di Drosophila per determinare la composizione, la localizzazione e l’eterogeneità della traduzione delle mRNP, fornendo risultati che consentiranno di offrire una comprensione dinamica della regolazione dell’mRNA.

Obiettivo

mRNAs are packed with RNA binding proteins (RBPs) to assemble the messenger ribonucleoprotein particles (mRNPs). Proper mRNP biogenesis, export, localization, translation, and decay are central for gene expression regulation. Each step requires specific RBPs mediating transcript interactions with the cellular machinery. So far, hundreds of RBPs have been identified begging the question of mRNP assembly diversity. While canonical RBPs are associated with all transcripts, some may be accessory, concurrent, and specific for subclasses of mRNAs. What finetunes mRNP compositions is not clear and understanding how specific mRNP compositions control mRNA fate is a major challenge for RNA biology.
mRNA localization and regulated translation are believed to be mechanisms to delimit gene expression to cellular sub-compartments ensuring that proteins are synthesized where they complete their functions. Furthermore, some mRNAs display heterogeneous translation efficiencies depending on their localization in cells. mRNA localization and translation heterogeneity appear to be highly dynamic and can be fine-tuned upon cell differentiation, or during stress. These phenomena seem crucial during development, particularly for large syncytial cells such as Drosophila embryos but their prevalence and functions are not understood.
We hypothesize that mRNA localization and translation kinetics are encoded by the different combinations of RBPs assembling the mRNPs. We aim to decipher the link between mRNP composition, localization, and translation heterogeneity for key mRNAs controlling embryonic patterning in Drosophila embryos. The mRNPcode project will combine mRNP capture, proteomic, and cutting-edge microscopy for single particle tracking and translation imaging to build a dynamic picture of mRNP composition, localization, and translation. The project tackles long-lasting questions beyond the Drosophila developmental field by exploring mRNP assembly and its imprinting on mRNA fates.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2023-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 211 754,88
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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