Descripción del proyecto
Mecanismos moleculares del empalme en trans: conocimientos estructurales y funcionales
El empalme en trans es un paso clave del procesamiento del ácido ribonucleico mensajero (ARNm) donde los exones de dos pre-ARNm se fusionan, mientras que el empalme en cis reorganiza los exones dentro de un ARNm. Aunque la microscopía crioelectrónica ha permitido avanzar en la comprensión del empalme en cis, los mecanismos del empalme en trans siguen siendo en gran medida desconocidos. El proyecto TRANSPLIC, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, mejorará la comprensión del empalme en trans mediante el ensamblaje de complejos de empalme en trans sobre matrices de pre-ARNm. Se examinarán los estados únicos de los transespliceosomas y sus estructuras moleculares, así como su comportamiento, en un contexto celular. Para ello, el equipo del proyecto empleará el protista «Trypanosoma brucei», que requiere empalme en trans para el procesamiento del ARNm, y combinará métodos «in vitro», microscopía crioelectrónica, proteómica y modelización asistida por inteligencia artificial. Los ensayos funcionales dirigidos contribuirán a esclarecer la secuencia de procesos que dan lugar al empalme en trans.
Objetivo
Trans-splicing is an essential mRNA processing step for a significant portion of living organisms. In trans-splicing, exons from two pre-mRNA precursors merge into a single mRNA, while cis-splicing rearranges exons within the mRNA. Despite recent technical advancements in cryo-electron microscopy (cryo-EM) that movie-like resolved different stages of cis-splicing, the trans-splicing mechanism is still a black box: input and output are defined, but the single steps of how the trans-spliceosome assembles and remodels to initiate the splicing cycle lie in the dark. This limitation is partially due to the absence of molecular structures resolving trans-splicing complexes. In TRANSPLIC, I will pioneer the assembly of trans-splicing complexes on pre-mRNA scaffolds to reveal the particular states unique to trans-spliceosomes. I will determine the molecular structures of trans-spliceosomes and uncover their behavior in the cellular context. Targeted functional assays will disclose the order of events leading to trans-splicing. The protist Trypanosoma brucei (Tb) will serve as an accessible model organism because it uses trans-splicing as an obligatory and abundant mRNA processing step. I will apply an ambitious approach that integrates in vitro and cell lysate-based methods, state-of-the-art cryo-EM, cryo-electron tomography, proteomics, and artificial intelligence-based computational modeling. I will complement the study through targeted functional experiments, leading to a complete understanding of the spatial-temporal resolution of trans-splicing in trypanosomes, with wider relevance to other organisms, including humans. The targeted fusion of gene sequences through trans-splicing bears potential as a molecular tool for transcriptome editing in the future.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
69117 Heidelberg
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.