Opis projektu
Molekularne mechanizmy składania genów - spostrzeżenia strukturalne i funkcjonalne
Trans-splicing to kluczowy etap przetwarzania mRNA, w którym eksony z dwóch prekursorów mRNA łączą się w jeden, podczas gdy cis-splicing przekształca eksony w obrębie pojedynczego mRNA. Choć kriomikroskopia elektronowa pozwoliła nam lepiej zrozumieć proces cis-splicingu, mechanizmy trans-splicingu pozostają niejasne. Zespół finansowanego ze środków ERBN projektu TRANSPLIC pogłębi naszą wiedzę na temat trans-splicingu poprzez tworzenie kompleksów na rusztowaniach prekursorów mRNA. Badacze przeanalizują wyjątkowe stany cząsteczek i ich struktury molekularne, a także ich zachowanie w kontekście komórkowym. Analizując protisty Trypanosoma brucei, które wymagają tego procesu do przetwarzania mRNA, zespół wykorzysta metody in vitro, kriomikroskopię elektronową, proteomikę i modelowanie przy użyciu sztucznej inteligencji. Badania funkcjonalne ujawnią sekwencję zdarzeń prowadzących do procesu trans-splicingu.
Cel
Trans-splicing is an essential mRNA processing step for a significant portion of living organisms. In trans-splicing, exons from two pre-mRNA precursors merge into a single mRNA, while cis-splicing rearranges exons within the mRNA. Despite recent technical advancements in cryo-electron microscopy (cryo-EM) that movie-like resolved different stages of cis-splicing, the trans-splicing mechanism is still a black box: input and output are defined, but the single steps of how the trans-spliceosome assembles and remodels to initiate the splicing cycle lie in the dark. This limitation is partially due to the absence of molecular structures resolving trans-splicing complexes. In TRANSPLIC, I will pioneer the assembly of trans-splicing complexes on pre-mRNA scaffolds to reveal the particular states unique to trans-spliceosomes. I will determine the molecular structures of trans-spliceosomes and uncover their behavior in the cellular context. Targeted functional assays will disclose the order of events leading to trans-splicing. The protist Trypanosoma brucei (Tb) will serve as an accessible model organism because it uses trans-splicing as an obligatory and abundant mRNA processing step. I will apply an ambitious approach that integrates in vitro and cell lysate-based methods, state-of-the-art cryo-EM, cryo-electron tomography, proteomics, and artificial intelligence-based computational modeling. I will complement the study through targeted functional experiments, leading to a complete understanding of the spatial-temporal resolution of trans-splicing in trypanosomes, with wider relevance to other organisms, including humans. The targeted fusion of gene sequences through trans-splicing bears potential as a molecular tool for transcriptome editing in the future.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA transkryptomy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
69117 Heidelberg
Niemcy
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.