Description du projet
Aperçus structurels et fonctionnels des mécanismes moléculaires de l’épissage trans
L’épissage trans est une étape essentielle du traitement de l’ARNm, où les exons de deux pré-ARNm fusionnent en un seul, tandis que l’épissage cis réorganise les exons au sein d’un unique ARNm. Alors que la microscopie cryoélectronique a fait progresser notre compréhension de l’épissage cis, les mécanismes de l’épissage trans demeurent flous. Le projet TRANSPLIC, financé par le CER, va améliorer notre compréhension de l’épissage trans en assemblant des complexes d’épissage trans sur des échafaudages pré-ARNm. Il examinera les états uniques des épisomes trans et leurs structures moléculaires, ainsi que leur comportement dans un contexte cellulaire. En utilisant le protiste Trypanosoma brucei (Tb), qui nécessite un épissage trans pour le traitement de l’ARNm, le projet intégrera des méthodes in vitro, la cryomicroscopie électronique, la protéomique et la modélisation de l’intelligence artificielle. Des tests fonctionnels ciblés révéleront la séquence d’événements qui mène à l’épissage trans.
Objectif
Trans-splicing is an essential mRNA processing step for a significant portion of living organisms. In trans-splicing, exons from two pre-mRNA precursors merge into a single mRNA, while cis-splicing rearranges exons within the mRNA. Despite recent technical advancements in cryo-electron microscopy (cryo-EM) that movie-like resolved different stages of cis-splicing, the trans-splicing mechanism is still a black box: input and output are defined, but the single steps of how the trans-spliceosome assembles and remodels to initiate the splicing cycle lie in the dark. This limitation is partially due to the absence of molecular structures resolving trans-splicing complexes. In TRANSPLIC, I will pioneer the assembly of trans-splicing complexes on pre-mRNA scaffolds to reveal the particular states unique to trans-spliceosomes. I will determine the molecular structures of trans-spliceosomes and uncover their behavior in the cellular context. Targeted functional assays will disclose the order of events leading to trans-splicing. The protist Trypanosoma brucei (Tb) will serve as an accessible model organism because it uses trans-splicing as an obligatory and abundant mRNA processing step. I will apply an ambitious approach that integrates in vitro and cell lysate-based methods, state-of-the-art cryo-EM, cryo-electron tomography, proteomics, and artificial intelligence-based computational modeling. I will complement the study through targeted functional experiments, leading to a complete understanding of the spatial-temporal resolution of trans-splicing in trypanosomes, with wider relevance to other organisms, including humans. The targeted fusion of gene sequences through trans-splicing bears potential as a molecular tool for transcriptome editing in the future.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.