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Mechanism of facilitated homology search and the logic of its meiotic regulations

Description du projet

Les mécanismes de la recombinaison homologue dans la mitose et la méiose

La recombinaison homologue, qui consiste à échanger des séquences de nucléotides entre deux molécules d’ADN similaires ou identiques, est largement utilisée pour réparer les cassures double brin (DSB pour «double-strand breaks») de l’ADN. Pour ce faire, les cellules doivent rechercher et identifier une molécule d’ADN modèle homologue intacte dans le génome. Malgré l’importance cruciale de cette recherche d’homologie pour le maintien du génome (mitose) et la reproduction sexuée (méiose), les mécanismes sont mal compris. Le projet Homologic, financé par le CER, vise à étudier l’hypothèse selon laquelle la composition de la chromatine et les mouvements mécaniques fournissent des indices pour la simplification et la régulation de la recherche au cours des deux processus. Le génie génétique, les grandes régions chromosomiques synthétiques et les nouvelles approches génomiques et moléculaires devraient apporter un éclairage sur la recombinaison homologue dans la mitose et la méiose.

Objectif

DNA double-strand breaks (DSB) repair by homologous recombination (HR) entails identification of an intact homologous template DNA molecule in the genome. Homology search is guided by the DSB-flanking ssDNA sequence assembled into a RecA-family nucleoprotein filament (NPF). A biased version of this process, regulated in an ill-defined manner by chromosomes’ structure and meiosis-specific HR proteins, also underlies homolog recognition and recombination during meiosis I in most examined eukaryotes. Despite its centrality for genome maintenance and sexual reproduction, how homology search operates in cells and the nature of its meiotic regulations are largely unknown. Our goal is to solve these two major biological conundrums with a simple idea: that substrate properties (chromatin composition and motion) provide cues for search simplification and regulation.
First, we will address the existence of a homology search facilitation mechanism based on combined (i) DNA occlusion by nucleosome and (ii) seeding of homology search by pioneer transcription factors (WP1). These insights will be applied to accelerate yeast evolution and improve gene-editing. Second, we will address how uncoordinated movements of semi-rigid meiotic chromosomes can generate mechanical cues underlying HR regulations that result in patterned recombination between homologs (WP2). The experimental strategy will involve extensive genetic engineering and large synthetic chromosomal regions for targeted alteration of chromatin composition, chromosome physical properties and chromosome motion in cis. Novel genomic and molecular approaches we developed to directly detect transient HR intermediates in yeast make this project uniquely feasible. This work should elucidate enigmatic interplays between chromosome biology and conserved DNA metabolic processes in mitosis and meiosis, broadens the current paradigm of facilitated target search by proteins in DNA, and yield tools of broad biotechnological interest.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG

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Institution d’accueil

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 999 999,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 999 999,00

Bénéficiaires (1)

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