Descrizione del progetto
Meccanismi di ricombinazione omologa in mitosi e meiosi
La ricombinazione omologa, che prevede lo scambio di sequenze nucleotidiche tra due molecole di DNA simili o identiche, è ampiamente utilizzata per riparare le rotture dannose del doppio filamento nel DNA. Per poterlo fare, le cellule devono cercare e individuare una molecola di DNA modello omologa intatta nel genoma. Nonostante l’importanza critica di questa ricerca di omologia per il mantenimento del genoma (mitosi) e la riproduzione sessuale (meiosi), i meccanismi sono poco conosciuti. Il progetto Homologic, finanziato dal CER, mira a studiare l’ipotesi che la composizione e il movimento meccanico della cromatina forniscano spunti per la semplificazione e la regolazione della ricerca durante entrambi i processi. L’ingegneria genetica, le grandi regioni cromosomiche sintetiche e i nuovi approcci genomici e molecolari dovrebbero far luce sulla ricombinazione omologa nella mitosi e nella meiosi.
Obiettivo
DNA double-strand breaks (DSB) repair by homologous recombination (HR) entails identification of an intact homologous template DNA molecule in the genome. Homology search is guided by the DSB-flanking ssDNA sequence assembled into a RecA-family nucleoprotein filament (NPF). A biased version of this process, regulated in an ill-defined manner by chromosomes’ structure and meiosis-specific HR proteins, also underlies homolog recognition and recombination during meiosis I in most examined eukaryotes. Despite its centrality for genome maintenance and sexual reproduction, how homology search operates in cells and the nature of its meiotic regulations are largely unknown. Our goal is to solve these two major biological conundrums with a simple idea: that substrate properties (chromatin composition and motion) provide cues for search simplification and regulation.
First, we will address the existence of a homology search facilitation mechanism based on combined (i) DNA occlusion by nucleosome and (ii) seeding of homology search by pioneer transcription factors (WP1). These insights will be applied to accelerate yeast evolution and improve gene-editing. Second, we will address how uncoordinated movements of semi-rigid meiotic chromosomes can generate mechanical cues underlying HR regulations that result in patterned recombination between homologs (WP2). The experimental strategy will involve extensive genetic engineering and large synthetic chromosomal regions for targeted alteration of chromatin composition, chromosome physical properties and chromosome motion in cis. Novel genomic and molecular approaches we developed to directly detect transient HR intermediates in yeast make this project uniquely feasible. This work should elucidate enigmatic interplays between chromosome biology and conserved DNA metabolic processes in mitosis and meiosis, broadens the current paradigm of facilitated target search by proteins in DNA, and yield tools of broad biotechnological interest.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica ereditarietà
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75794 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.