Description du projet
L’interaction des processus d’expression génétique
L’interaction complexe entre les processus d’expression des gènes bactériens est mal comprise. Des mécanismes fondamentaux tels que la transcription, la traduction et la réparation de l’ADN fonctionnent souvent en parallèle, mais on sait peu de choses sur la manière dont ils sont fonctionnellement couplés. Le projet RNP5D, financé par le CER, entend résoudre ce problème en étudiant la manière dont ces processus interagissent au niveau moléculaire. En s’appuyant sur des techniques avancées de biophysique des molécules uniques, de biochimie et de biologie structurale, le projet reconstituera les systèmes de transcription-translation et les voies de réparation de l’ADN in vitro et in vivo. En intégrant ces systèmes, le projet entend découvrir la manière dont ces processus cellulaires essentiels coopèrent ou entrent en concurrence, ce qui permettra de mieux comprendre la régulation de l’expression génétique et d’établir une nouvelle norme pour l’étude des systèmes biologiques complexes.
Objectif
This proposal brings together the fields of bacterial transcription, translation and DNA repair with state-of-the art single-molecule biophysics in vitro and in vivo, biochemistry and structural biology to address a central but understudied question in biology: how are different macromolecular processes interconnected and functionally coupled? I aim to elucidate this by investigating the crosstalk between central processes in bacterial gene expression: transcription, translation and DNA repair.
First, to understand what determines whether transcription is coupled to translation, we will reconstitute the complete transcription-translation system in vitro and image the process in real-time using cutting-edge multi-color single-molecule fluorescence experiments. We will support our dynamic single-molecule data with structural information from cryo-electron tomography. In order to verify that our in vitro data also have physiological relevance, we will electroporate reconstituted and labelled RNAP/ribosome complexes into live E. coli cells for multi-color single-molecule imaging also in vivo.
Second, we will reconstitute the transcription-coupled DNA nucleoside excision repair pathway in vitro. Integrating multi-color single-molecule fluorescence with optical tweezer assays, will allow us to resolve a controversial point on how transcription-coupled DNA repair starts, comparing the established concept of Mfd-initiation with the newly proposed UvrD/RNAP-mediated lesion recognition.
Finally, we will develop single-molecule experiments for integrating all three processes, specifically transcription, translation and DNA repair, into a single system to quantify cooperativity and competition between individual components and processes.
Overall, this proposal will provide quantitative and mechanistic understanding of how central processes to gene expression are functionally interconnected, setting a new benchmark for examining complex biological systems in context.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques biophysique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.