ERA-Chair in Tree Bioengineering

Projektinformationen

TreeBioTEC

ID Finanzhilfevereinbarung: 101187823

DOI

10.3030/101187823

EK-Unterschriftsdatum 22 Oktober 2024

Startdatum 1 März 2025

Enddatum 28 Februar 2030

Finanziert unter

• Widening participation and spreading excellence

Gesamtkosten

Keine Daten

EU-Beitrag

€ 2 499 080,00

Koordiniert durch

TARTU ULIKOOL
Estonia

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (13)

The Late Quaternary climate impact on the genome of the woodland strawberry (Fragaria vesca), a perennial herb

Autoren: Tuomas Toivainen, J. Sakari Salonen, Jonathan Kirshner, Sergei Lembinen, Hanne De Kort, Annina Lyyski, Patrick P. Edger, Hrannar Smári Hilmarsson, Jón Hallsteinn Hallsson, Daniel J. Sargent, Klaus Olbricht, José F. Sánchez-Sevilla, Laura Jaakola, Johan A. Stenberg, Boris Duralija, Juozas Labokas, Henry Väre, Jarkko Salojärvi, Petri Auvinen, David Posé, Victor A. Albert, Timo Hytönen
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 9, 2026, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S42003-026-09539-5

Gene regulatory network analysis of silver birch reveals the ancestral state of secondary cell wall biosynthesis in core eudicots

Autoren: Maja Ilievska, Sun‐Li Chong, Kean‐Jin Lim, Juha Immanen, Kaisa Nieminen, Hannu Maaheimo, Yrjö Helariutta, Joel Wurman‐Rodrich, Paul Dupree, James Ord, Maija Tenkanen, Jarkko Salojärvi
Veröffentlicht in: New Phytologist, Ausgabe 246, 2026, ISSN 0028-646X
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/NPH.70126

Independent evolution of betulin biosynthesis in Inonotus obliquus

Autoren: Omid Safronov, Güleycan Lutfullahoglu Bal, Nina Sipari, Maya Wilkens, Pezhman Safdari, Olli-Pekka Smolander, Pia K. Laine, Jenna Lihavainen, Niko Silvan, Sitaram Rajaraman, Lars G. Paulin, Teemu H. Teeri, Petri Auvinen, Tytti Sarjala, Kirk Overmyer, Uwe Richter, Jarkko Salojärvi
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 15, 2025, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/S41598-025-05414-1

The ZAT14 family promotes cell death and regulates expansins to affect xylem formation and salt tolerance in Arabidopsis

Autoren: Ming Feng, Amrit K Nanda, Frauke Augstein, Ai Zhang, Lihua Zhao, Nilam Malankar, Sam W van Es, Bernhard Blob, Shamik Mazumdar, Jung-Ok Heo, Pawel Roszak, Jinbo Hu, Yrjö Helariutta, Charles W Melnyk
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 37, 2025, ISSN 1040-4651
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/PLCELL/KOAF271

Genetic diversity and adaptive evolutionary history of <i>Sapindus</i> in China: insights from whole‐genome resequencing of 100 representative individuals

Autoren: Jiming Liu, Guochun Zhao, Yulin Zheng, Yuanyuan Xu, Mianzhi Wang, Lu Li, Caowen Sun, Qiuyang He, Rami‐Petteri Apuli, Joan Jing Yi Jong, Jia Jun Ngiam, Andrey Vaulin, Roy Jun Kai Tham, Liming Jia, Zhong Chen, Jarkko Salojärvi
Veröffentlicht in: Plant Biotechnology Journal, Ausgabe 23, 2025, ISSN 1467-7644
Herausgeber: Wiley
DOI: 10.1111/PBI.70058

<i>PHLOEM EARLY DOF</i> genes are induced within clubroot galls as a consequence of cambial stimulation and vascular reprogramming during <i>Plasmodiophora brassicae</i> infection in <i>Arabidopsis thaliana</i>

Autoren: Deeksha Singh, Sara Blicharz, Pawel Roszak, Yrjö Helariutta, Robert Malinowski
Veröffentlicht in: Journal of Experimental Botany, Ausgabe 76, 2025, ISSN 0022-0957
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/JXB/ERAF225

Single-cell and spatial transcriptomics in Phragmites australis reveal the association of B chromosomes with plant invasiveness

Autoren: Cui Wang; James Ord; Mengxiao Yan; Yunfei Cai; Hongjin Shao; Lele Lin; Jarkko Salojärvi; Lele Liu; Weihua Guo
Veröffentlicht in: Genome Biology, 2026, ISSN 1474-760X
Herausgeber: BioMed Central Ltd
DOI: 10.1186/S13059-026-04079-X

Plasmodesmata act as unconventional membrane contact sites regulating intercellular molecular exchange in plants

Autoren: Jessica Pérez-Sancho; Marija Smokvarska; Gwennogan Dubois; Marie Glavier; Sujith Sritharan; Tatiana S Moraes; Hortense Moreau; Victor Dietrich; Matthieu P Platre; Andrea Paterlini; Ziqiang P Li; Laetitia Fouillen; Magali S Grison; Pepe Cana-Quijada; Franç
Veröffentlicht in: Cell, 2025, ISSN 1097-4172
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/J.CELL.2024.11.034

Reconstructing community dynamics from limited observations

Autoren: Chandler Ross, Ville Laitinen, Moein Khalighi, Jarkko Salojärvi, Willem M. de Vos, Guilhem Sommeria-Klein, Leo Lahti
Veröffentlicht in: Microbiome, 2026, ISSN 2049-2618
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1186/S40168-026-02449-Y

InDel variation and contraction of the C-repeat binding factor family contribute to cold sensitivity in <i>Betula fujianensis</i>

Autoren: Hebi Zhuang, Erpei Lin, Jianbo Xie, Mei Jiang, Fei Ni, Shuaibin Shi, Meng Liu, Siyu Miao, Ming Wei, Chenghao Li, Jiming Liu, Xiaojuan Liu, Xian-Ge Hu, Wenwu Wu, Jarkko Salojärvi, Huahong Huang
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 37, 2025, ISSN 1040-4651
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/PLCELL/KOAF216

Recruitment of bifunctional regulator thermospermine to methylated ribosomes directs xylem fate

Autoren: Donghwi Ko, Raili Ruonala, Alexandre Faille, Eva Hellmann, Hanna Help, Huili Liu, Ronni Nielsen, Anders Haakonsson, Nuria De Diego, Anja Paatero, Mariia V. Shcherbii, Karolina Stefanowicz, Sanja Ćavar Zeljković, Tine Drud Lundager Rasmussen, Ondrej Novak, Zsuzsanna Bodi, Gugan Eswaran, Brecht Wybouw, Matthieu Bourdon, Cristina Urbez, Xiaonan Liu, Kari Salokas, Tiina Öhman, Tanya Waldie, Petri Törönen, Sedeer el-Showk, Martin Balcerowicz, Fabrice Besnard, Xiaomin Liu, Patrick Perkins, Serina Mazzoni-Putman, Julia P. Vainonen, Maija Sierla, Mikko J. Frilander, Susanne Mandrup, Teva Vernoux, Karin Ljung, Alejandro Ferrando, Miguel A. Blazquez, Liisa Holm, Rupert Fray, Markku Varjosalo, Ottoline Leyser, Ville O. Paavilainen, Ari Pekka Mähönen, Anna Stepanova, Jose Alonso, Steffen Heber, Robert Malinowski, Finn Kirpekar, Alan J. Warren, Ykä Helariutta
Veröffentlicht in: Science, Ausgabe 391, 2026, ISSN 0036-8075
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1126/SCIENCE.ADX2867

Cryo-EM structure of the Arabidopsis thaliana ribosome in translating and non-translating states

Autoren: Sudeep Karki, Xun Lu, Anja O. Paatero, Raili Ruonala, Dale Tranter, Sergey Guryanov, Shahid Rehan, Eva Hellmann, Anders Haakonsson, Sarah J. Butcher, Juha T. Huiskonen, Tommi Kajander, Yrjö Helariutta, Ville O. Paavilainen
Veröffentlicht in: Structure, Ausgabe 34, 2026, ISSN 0969-2126
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/J.STR.2026.06.001

Plant hormone and peptide signaling converge in the genetic network regulating cambium activation in Arabidopsis roots

Autoren: Tiina Blomster, Riccardo Siligato, Riikka Mäkilä, Wiktoria Fatz, Munan Lyu, Maria Angels de Luis Balaguer, Lingling Ye, Iris Gildea, Omid Safronov, Panu Somervuo, Kamil Růžička, Jarkko Salojärvi, Rosangela Sozzani, Melis Kucukoglu Topcu, Ari Pekka Mähönen
Veröffentlicht in: The Plant Cell, Ausgabe 38, 2026, ISSN 1040-4651
Herausgeber: Oxford University Press (OUP)
DOI: 10.1093/PLCELL/KOAG059