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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Differential Diagnosis of Autoimmune Hepatitis by cfChIP-seq Liquid Biopsy

Descripción del proyecto

Biopsia líquida basada en el ADN para el diagnóstico de enfermedades hepáticas

La identificación precisa de las causas de los trastornos hepáticos es crucial para un tratamiento eficaz. Sin embargo, sigue siendo difícil diferenciar entre hepatitis autoinmune, daño hepático medicamentoso y otras enfermedades hepáticas no víricas. El diagnóstico de la hepatitis autoinmunitaria suele implicar una combinación de análisis de sangre para detectar autoanticuerpos específicos, pruebas de la función hepática y, a menudo, una biopsia hepática para confirmar la presencia de inflamación y actividad autoinmunitaria. El objetivo clave del proyecto AIHLiquidBiopsy, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, es sustituir las biopsias hepáticas invasivas por una biopsia líquida mínimamente invasiva. La tecnología propuesta analizará las marcas epigenéticas en el ADN libre de células procedente de muestras de sangre. Ello permitirá cartografiar la actividad génica de todo el genoma asociada al daño hepático y el diagnóstico diferencial de enfermedades hepáticas.

Objetivo

The identification of the causative agent and mechanism of liver disorders is essential for effective treatment. The diagnostic challenge is differentiating autoimmune hepatitis, drug induced liver damage, and other non-viral causes of liver disease. Current diagnostic guidelines require in many cases liver biopsy followed by monitoring response to treatment before conclusive diagnosis. Our objective is to replace liver biopsy in the parenchymal liver disease settings with a minimally invasive liquid biopsy from a blood sample.

We have developed cfChIP-seq, a liquid biopsy that enables detection of gene activity in the cells contributing to cell-free DNA. Cell-free DNA is mostly chromatin fragments DNA-protein complexes. These carry post-translational epigenetic marks that are closely connected to gene regulation and activity in the cell of origin. By capturing fragments marked with active transcription and sequencing their DNA, we map genome-wide activity of genes in the cells contributing to circulating cell-free DNA.

Liver damage results in increased contribution of liver cells to circulating cell-free DNA. Moreover, our preliminary results show that we can detect differences in the cfChIP-seq signal from different liver pathologies and that these differences involve genes associated with the relevant liver damage mechanisms.

We plan to develop methods for differential diagnosis of autoimmune liver diseases such as autoimmune hepatitis and other parenchymal liver diseases. This will be supplemented by a multi-center cohort of patients to train and validate these tools. Together these will establish a pre-clinical evaluation of the capabilities of the assay in differential diagnosis and enable development of a product that would change the way we diagnose these diseases. This product will improve the quality of diagnosis, reduce the number of liver biopsies, risk to patients and costs, and provide more detailed follow-up during treatment.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-ERC-POC - HORIZON ERC Proof of Concept Grants

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Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-POC

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Institución de acogida

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 150 000,00
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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Beneficiarios (1)

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