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Deciphering host genetics and viral determinants of MPOX epidemiology in the Democratic Republic of Congo

Description du projet

Percer les mystères de la variole du singe

Le nombre de cas de variole du singe, un virus apparenté à la variole, a connu une forte augmentation en dehors de ses régions endémiques africaines habituelles, la transmission récente étant liée à des contacts sexuels. Toutes les personnes exposées au virus ne développent toutefois pas de symptômes graves ni ne tombent malades. Le projet DECIPHER-MPOX, financé par l’UE, entend en comprendre les raisons. Concentrant leurs efforts sur la région de Kamituga dans le Sud-Kivu, en RDC, les chercheurs étudieront les facteurs génétiques et viraux de l’hôte qui influencent l’évolution de la maladie. En analysant des cohortes de familles et en menant des études génétiques, transcriptomiques et de profil immunitaire, le projet espère révéler les déterminants de la prédisposition et de la protection, ce qui pourrait orienter les futures stratégies vaccinales.

Objectif

Background: Monkeypox virus (MPV) is a member of the Poxviridae family that includes smallpox, cowpox and chickenpox viruses. Endemic to equatorial Africa following casual human to animal or human to human transmission , recent events have seen an increased incidence with indications of sexual transmission. The disease is characterized by fever, muscle aches, skin rash, lymphadenopathy, oral sores, sore throat, cough, etc. Within any cluster of high risk contacts of a case mpox; however, not everyone exposed develops clinical disease. Moreover, among those contacts who develop mpox, not everyone gets severe disease or dies.
Hypothesis: Host genetic & viral factors explain the differential outcomes following exposure to MPV.
Objectives: To determine the host genetic and viral determinants of mpox disease in Kamituga area, South Kivu province, DRC. Specifically, we will (I) establish well phenotyped cohorts of house-hold contacts, (II) determine rare variants via family trios; (III) undertake RNASeq for transcriptomics, and (IV) study differential cellular immunity profiles using digital cell sorting (DCS) , (V) identify viral variants that drive severe disease
Methods: Whole exome sequencing (WES), transcriptomics and DCS studies of house-family contacts clinically prequalified by PCR and serological testing. Virus gDNA will be reverse transcribed from sequenced host RNA and characterized by comparative genomics and phylogeny.
Potential impact: This project will elucidate host genetic & viral determinants of susceptibility to mpox disease in context of natural exposure and infection; that may serve as correlates of immune protection following vaccination.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-JU-RIA - HORIZON JU Research and Innovation Actions

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-JU-GH-EDCTP3-2024-Mpox

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

NATIONAL HEALTH LABORATORY SERVICES
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 156 750,00
Adresse
MODDERFONTEIN ROAD 1 GAUTENG
2131 Sandringham
Afrique du Sud

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Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 156 750,00

Participants (6)

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