Descrizione del progetto
Svelare i misteri dell’mpox
L’mpox, un virus correlato al vaiolo, ha registrato un aumento dei casi al di fuori delle consuete regioni endemiche africane, i più recenti dei quali sono dovuti a trasmissione per contatto sessuale; ciononostante, non tutte le persone esposte al virus sviluppano sintomi gravi o si ammalano. Il progetto DECIPHER-MPOX, finanziato dall’UE, si prefigge di comprenderne le ragioni. Concentrandosi sull’area di Kamituga nella regione del Kivu Sud, nella Repubblica Democratica del Congo, i ricercatori studieranno i fattori genetici e virali legati all’organismo ospitante che influenzano gli esiti clinici della malattia. Analizzando coorti familiari e conducendo studi genetici, trascrittomici e di profilo immunitario, il progetto si augura di scoprire i determinanti della suscettibilità e della protezione, con il potenziale di guidare l’elaborazione delle future strategie vaccinali.
Obiettivo
Background: Monkeypox virus (MPV) is a member of the Poxviridae family that includes smallpox, cowpox and chickenpox viruses. Endemic to equatorial Africa following casual human to animal or human to human transmission , recent events have seen an increased incidence with indications of sexual transmission. The disease is characterized by fever, muscle aches, skin rash, lymphadenopathy, oral sores, sore throat, cough, etc. Within any cluster of high risk contacts of a case mpox; however, not everyone exposed develops clinical disease. Moreover, among those contacts who develop mpox, not everyone gets severe disease or dies.
Hypothesis: Host genetic & viral factors explain the differential outcomes following exposure to MPV.
Objectives: To determine the host genetic and viral determinants of mpox disease in Kamituga area, South Kivu province, DRC. Specifically, we will (I) establish well phenotyped cohorts of house-hold contacts, (II) determine rare variants via family trios; (III) undertake RNASeq for transcriptomics, and (IV) study differential cellular immunity profiles using digital cell sorting (DCS) , (V) identify viral variants that drive severe disease
Methods: Whole exome sequencing (WES), transcriptomics and DCS studies of house-family contacts clinically prequalified by PCR and serological testing. Virus gDNA will be reverse transcribed from sequenced host RNA and characterized by comparative genomics and phylogeny.
Potential impact: This project will elucidate host genetic & viral determinants of susceptibility to mpox disease in context of natural exposure and infection; that may serve as correlates of immune protection following vaccination.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP.
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Parole chiave
Programma(i)
- HORIZON.2.1 - Health Main Programme
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
HORIZON-JU-RIA - HORIZON JU Research and Innovation ActionsCoordinatore
2131 Sandringham
Sud Africa