Descripción del proyecto
Mapeo dinámico del tubo gastrointestinal humano
El revestimiento del tubo gastrointestinal sufre cambios continuos durante el desarrollo postnatal, así como en respuesta a diferentes enfermedades gastrointestinales. Analizar estos cambios ha resultado complicado debido a las dificultades para obtener biopsias repetidas y a la limitada capacidad de interpretación de las mediciones transcriptómicas estáticas. En el proyecto GI-DYNAMICS, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, se estudiarán los cambios dinámicos que se producen en el tubo gastrointestinal. Los investigadores emplearán un método atraumático para analizar el transcriptoma de las células viables que se desprenden de forma natural en las heces, lo cual posibilitará determinar en tiempo real el estado de los tejidos. También combinarán mediciones de tejido y células desprendidas para cuantificar propiedades dinámicas como, por ejemplo, la tasa de renovación celular. Entre los objetivos principales del proyecto figuran cartografiar el desarrollo gastrointestinal en lactantes, descubrir los mecanismos de resistencia a la muerte celular en el cáncer colorrectal e investigar las adaptaciones tisulares en la celiaquía.
Objetivo
The gastrointestinal (GI) tract undergoes significant changes during post-natal development and in response to various diseases. Single-cell atlases are static and therefore fail to capture the dynamic changes occurring within the GI tract. We have devised a method to transcriptomically profile cells that are naturally shed into the GI tract. Contrary to earlier beliefs, we found that shed cells remain viable and can robustly be measured in fecal samples. Shed cell transcriptomics enables non-invasive tracking of cellular states throughout development and disease progression. Moreover, discrepancies between transcriptomic profiles of shed cells and tissues can identify which cell types are preferentially shed or retained, revealing cell turnover patterns. Our objective is to combine shed-cell and spatial transcriptomics to achieve basic and biomedical discoveries that were not possible before: 1. To study the developmental changes in the neonatal human GI tract. This will include longitudinal acquisition and in-depth analysis of shed cell transcriptomic and proteomic data in stool samples obtained from babies. 2. To characterize turnover of cells in colorectal cancer (CRC). We will combine shed cell transcriptomics in stool and blood with spatial transcriptomics of tumor biopsies to spatially map the cancer cells that resist death/shedding and examine their interactions within the tumor microenvironment. 3. To investigate cellular dynamics and tissue adaptations in Celiac disease. This will involve shed cell transcriptomics and high-resolution spatial transcriptomics to thoroughly understand the turnover rates of various enterocyte sub-populations and tissue adaptations during the disease. Our innovative use of shed cell transcriptomics will add a dynamic dimension to human cell atlas reconstruction efforts, enriching our understanding of tissue processes in health and disease.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ARN transcriptomas
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
7610001 Rehovot
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.