Descrizione del progetto
Mappatura dinamica del tratto gastrointestinale umano
Il rivestimento del tratto gastrointestinale subisce continui cambiamenti durante lo sviluppo postnatale e in diverse patologie gastrointestinali. Analizzare questi cambiamenti è stato impegnativo a causa delle difficoltà nell’ottenere biopsie ripetute e nell’interpretare misurazioni trascrittomiche statiche. Il progetto GI-DYNAMICS, finanziato dal CER, studierà i cambiamenti dinamici che si verificano nel tratto gastrointestinale. I ricercatori impiegheranno un metodo non invasivo per tracciare il profilo dei trascrittomi delle cellule vitali naturalmente presenti nelle feci, catturando in questo modo gli stati dei tessuti in tempo reale. Combineranno inoltre le misurazioni dei tessuti e delle cellule espulse per quantificare proprietà dinamiche come i tassi di turnover cellulare. Tra gli obiettivi principali rientrano la mappatura dello sviluppo gastrointestinale nei neonati, la scoperta dei meccanismi di resistenza alla morte cellulare nel cancro del colon-retto e lo studio degli adattamenti tissutali nella celiachia.
Obiettivo
The gastrointestinal (GI) tract undergoes significant changes during post-natal development and in response to various diseases. Single-cell atlases are static and therefore fail to capture the dynamic changes occurring within the GI tract. We have devised a method to transcriptomically profile cells that are naturally shed into the GI tract. Contrary to earlier beliefs, we found that shed cells remain viable and can robustly be measured in fecal samples. Shed cell transcriptomics enables non-invasive tracking of cellular states throughout development and disease progression. Moreover, discrepancies between transcriptomic profiles of shed cells and tissues can identify which cell types are preferentially shed or retained, revealing cell turnover patterns. Our objective is to combine shed-cell and spatial transcriptomics to achieve basic and biomedical discoveries that were not possible before: 1. To study the developmental changes in the neonatal human GI tract. This will include longitudinal acquisition and in-depth analysis of shed cell transcriptomic and proteomic data in stool samples obtained from babies. 2. To characterize turnover of cells in colorectal cancer (CRC). We will combine shed cell transcriptomics in stool and blood with spatial transcriptomics of tumor biopsies to spatially map the cancer cells that resist death/shedding and examine their interactions within the tumor microenvironment. 3. To investigate cellular dynamics and tissue adaptations in Celiac disease. This will involve shed cell transcriptomics and high-resolution spatial transcriptomics to thoroughly understand the turnover rates of various enterocyte sub-populations and tissue adaptations during the disease. Our innovative use of shed cell transcriptomics will add a dynamic dimension to human cell atlas reconstruction efforts, enriching our understanding of tissue processes in health and disease.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA trascrittomi
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
7610001 Rehovot
Israele
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.