Description du projet
Cartographie dynamique de l’appareil digestif humain
La muqueuse de l’appareil digestif subit des modifications continues au cours du développement postnatal et dans diverses maladies gastro-intestinales. L’étude de ces changements s’est avérée complexe en raison des difficultés à obtenir des biopsies répétées et interpréter des mesures transcriptomiques statiques. Le projet GI-DYNAMICS, financé par le CER, va examiner les changements dynamiques qui se produisent dans le tube digestif. Les chercheurs feront appel à une méthode non invasive pour analyser les transcriptomes des cellules viables naturellement éliminées dans les selles, capturant ainsi en temps réel l’état des tissus. Ils combineront également des mesures de tissus et de cellules mortes afin de quantifier diverses propriétés dynamiques telles que les taux de renouvellement cellulaire. Ses principaux objectifs sont la cartographie du développement gastro-intestinal chez les nourrissons, la découverte des mécanismes de résistance à la mort cellulaire dans le cancer colorectal et l’étude des adaptations tissulaires dans la maladie cœliaque.
Objectif
The gastrointestinal (GI) tract undergoes significant changes during post-natal development and in response to various diseases. Single-cell atlases are static and therefore fail to capture the dynamic changes occurring within the GI tract. We have devised a method to transcriptomically profile cells that are naturally shed into the GI tract. Contrary to earlier beliefs, we found that shed cells remain viable and can robustly be measured in fecal samples. Shed cell transcriptomics enables non-invasive tracking of cellular states throughout development and disease progression. Moreover, discrepancies between transcriptomic profiles of shed cells and tissues can identify which cell types are preferentially shed or retained, revealing cell turnover patterns. Our objective is to combine shed-cell and spatial transcriptomics to achieve basic and biomedical discoveries that were not possible before: 1. To study the developmental changes in the neonatal human GI tract. This will include longitudinal acquisition and in-depth analysis of shed cell transcriptomic and proteomic data in stool samples obtained from babies. 2. To characterize turnover of cells in colorectal cancer (CRC). We will combine shed cell transcriptomics in stool and blood with spatial transcriptomics of tumor biopsies to spatially map the cancer cells that resist death/shedding and examine their interactions within the tumor microenvironment. 3. To investigate cellular dynamics and tissue adaptations in Celiac disease. This will involve shed cell transcriptomics and high-resolution spatial transcriptomics to thoroughly understand the turnover rates of various enterocyte sub-populations and tissue adaptations during the disease. Our innovative use of shed cell transcriptomics will add a dynamic dimension to human cell atlas reconstruction efforts, enriching our understanding of tissue processes in health and disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN transcriptomes
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
7610001 Rehovot
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.