Description du projet
De nouvelles perspectives moléculaires sur la dynamique des chromosomes
La formation et la ségrégation des chromosomes durant la mitose impliquent le raccourcissement et l’épaississement de l’ADN. Les complexes protéiques, notamment la condensine, jouent un rôle central dans la dynamique des chromosomes durant ce processus. Les mécanismes moléculaires qui sous-tendent la fonction de la condensine demeurent toutefois obscurs. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet Chromofold s’appuiera sur une approche informatique pour étudier le repliement de la chromatine médié par la condensine et construire un modèle complet de la fonction de la condensine. Les chercheurs souhaitent comprendre si la condensine est impliquée dans le regroupement de segments d'ADN en boucles ou en clusters, un processus connu sous le nom de séparation de phase induite par pontage. Les résultats du projet permettront de mieux comprendre comment la perturbation des complexes de condensine peut causer une instabilité chromosomique.
Objectif
In human cells, the SMC complex condensin plays a significant and essential role in chromosome condensation, but there is conflicting data. Studies from other groups have suggested that the loop extruding activity of condensin is important for chromosome folding, but a study from my host lab suggested that loop extrusion (LE) alone is not able to package chromosomes. Using molecular biology experiments and polymer simulations they hypothesized that condensin has an additional bridging induced phase separation (BIPS) activity that is required for correct chromosome folding. In its absence, chromosomes are not fully compacted leading to chromosome instability.
I will collaborate closely with polymer physicists in Edinburgh to interpret experimental data and to understand how different condensin activities are necessary for chromosome folding. Together, we expect to provide a new model of condensin molecular functions based on experiments in vivo analyzed together with simulations of mitotic chromosomes. Deviations between simulations and experiments will be used to identify gaps in our knowledge leading to new hypothesis generation.
My aim is to investigate how different condensin activities (BIPS vs LE) regulate mitotic chromosome folding. To achieve this I have the following objectives:
(i) Use an in silico model of condensin-mediated chromatin folding with diverse levels of LE and BIPS to develop models of chromosome folding and generate testable hypotheses and predictions.
(ii) In human cells replace endogenous condensin components with already identified separation of function mutants to alter the balance between BIPS and LE activities and assess their role in chromosome folding.
(iii) Explore how different mutations affect condensin binding and clustering on mitotic chromosomes using super-resolution microscopy.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie à super-résolution
- sciences naturelles sciences chimiques science des polymères
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.