Descrizione del progetto
Nuove intuizioni molecolari sulla dinamica dei cromosomi
La formazione e la segregazione dei cromosomi durante la mitosi comportano l’accorciamento e l’ispessimento del DNA. I complessi proteici, quali la condensina, svolgono un ruolo centrale nella dinamica dei cromosomi durante questo processo. Tuttavia, i meccanismi molecolari alla base della funzione della condensina sono ancora poco chiari. Con il supporto del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto Chromofold utilizzerà un approccio computazionale per studiare il ripiegamento della cromatina mediato dalla condensina e realizzare un modello completo della funzione della condensina. I ricercatori del progetto intendono comprendere se la condensina è implicata nel trascinamento del DNA in anse o nel raggruppamento dei segmenti di DNA in un processo noto come separazione di fase indotta da bridging. I risultati del progetto contribuiranno a delineare come l’alterazione dei complessi di condensina possa causare instabilità cromosomica.
Obiettivo
In human cells, the SMC complex condensin plays a significant and essential role in chromosome condensation, but there is conflicting data. Studies from other groups have suggested that the loop extruding activity of condensin is important for chromosome folding, but a study from my host lab suggested that loop extrusion (LE) alone is not able to package chromosomes. Using molecular biology experiments and polymer simulations they hypothesized that condensin has an additional bridging induced phase separation (BIPS) activity that is required for correct chromosome folding. In its absence, chromosomes are not fully compacted leading to chromosome instability.
I will collaborate closely with polymer physicists in Edinburgh to interpret experimental data and to understand how different condensin activities are necessary for chromosome folding. Together, we expect to provide a new model of condensin molecular functions based on experiments in vivo analyzed together with simulations of mitotic chromosomes. Deviations between simulations and experiments will be used to identify gaps in our knowledge leading to new hypothesis generation.
My aim is to investigate how different condensin activities (BIPS vs LE) regulate mitotic chromosome folding. To achieve this I have the following objectives:
(i) Use an in silico model of condensin-mediated chromatin folding with diverse levels of LE and BIPS to develop models of chromosome folding and generate testable hypotheses and predictions.
(ii) In human cells replace endogenous condensin components with already identified separation of function mutants to alter the balance between BIPS and LE activities and assess their role in chromosome folding.
(iii) Explore how different mutations affect condensin binding and clustering on mitotic chromosomes using super-resolution microscopy.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze fisiche ottica microscopia microscopia a super risoluzione
- scienze naturali scienze chimiche scienze dei polimeri
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
EH8 9YL Edinburgh
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.