Descripción del proyecto
Hacia una ciencia predictiva de los microbiomas
Las comunidades microbianas son ecosistemas complejos. Estudiarlas no es fácil porque los modelos disponibles suelen ser demasiado simplistas. Herramientas como las ecuaciones de Lotka-Volterra no pueden captar plenamente las interacciones metabólicas que dan forma a estos sistemas. Una teoría más profunda y precisa podría transformar tanto la ecología como la microbiología. Comprender esta dinámica es clave para predecir el comportamiento microbiano. En este contexto, el proyecto MetaMicro, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, pretende construir una nueva teoría de la ecología microbiana basada en el metabolismo. Utilizando herramientas de la mecánica estadística y experimentos con la microbiota intestinal, explorará qué impulsa la composición de la comunidad, el éxito de las especies y el papel de los entornos de acogida. El objetivo es lograr que la ciencia del microbioma sea predictiva y guíe la manipulación selectiva de los ecosistemas microbianos.
Objetivo
Theoretical ecology has genuine potential to revolutionise microbiology, and vice versa. However, current models, such as the Lotka-Volterra equations, are typically too simplistic to apply and test rigorously. Critically, these models fail to capture microbial metabolism, which my lab and others have found central to predicting the ecology of diverse communities. My goal, therefore, is to develop a new theory of microbial ecology, rooted in metabolism, and to rigorously test it. We will capture nutrient competition, cross-feeding, interference competition and phage, and build our framework using methods from statistical mechanics. Throughout, we will experimentally test our theory using the gut microbiota as a model system. We will address three fundamental questions: 1: What determines the composition and stability of communities? Theory will be parameterised with large-scale culturing on defined media, metabolomics and whole-genome metabolic models. We will empirically test our ability to predict composition and ecological stability, and to understand the diversity-stability relationship. 2: What determines ecological success? We will study what makes a strain successful within a community, incorporating metabolism, bacterial warfare, and phage predation. 3: How does the host environment shape microbial ecology? We will employ agent-based simulations to capture spatial structure and test them with a new in-vitro organoid model of the human gut mucosa and our new in-vivo imaging pipeline for mouse microbiomes. Our plans have risk because ecological systems are complex and hard to understand. However, our work promises to deliver a step-change in both ecology and microbiology by making the study of microbial communities a predictive science, where one can understand ahead-of-time how particular sets of species will behave as a system. Furthermore, we will help establish the ecological principles needed to rationally manipulate our own microbiomes.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología virología
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2024-ADG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
OX1 2JD Oxford
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.