Opis projektu
W kierunku predykcyjnej nauki o mikrobiomach
Społeczności drobnoustrojów tworzą złożone ekosystemy. Ich badanie nie jest łatwe, ponieważ dostępne modele są często zbyt uproszczone. Narzędzia, takie jak równanie Lotki-Volterry, nie są w stanie w pełni uchwycić interakcji metabolicznych kształtujących te systemy. Z drugiej strony, bardziej pogłębione i precyzyjne teorie mogłyby wpłynąć zarówno na rozwój ekologii, jak i mikrobiologii. Zrozumienie tej dynamiki jest kluczem do przewidywania zachowania drobnoustrojów. W tym kontekście zespół finansowanego przez ERBN projektu MetaMicro planuje opracować nową teorię ekologii drobnoustrojów opartą na metabolizmie. Korzystając z narzędzi mechaniki statystycznej i eksperymentów z mikrobiotą jelitową, badacze chcą ustalić, jakie czynniki budują skład społeczności i odpowiadają za sukces gatunków oraz rolę środowiska gospodarza. Celem projektu jest uczynienie nauki o mikrobiomie bardziej przewidywalną oraz umożliwienie świadomego kształtowania ekosystemów mikroorganizmów.
Cel
Theoretical ecology has genuine potential to revolutionise microbiology, and vice versa. However, current models, such as the Lotka-Volterra equations, are typically too simplistic to apply and test rigorously. Critically, these models fail to capture microbial metabolism, which my lab and others have found central to predicting the ecology of diverse communities. My goal, therefore, is to develop a new theory of microbial ecology, rooted in metabolism, and to rigorously test it. We will capture nutrient competition, cross-feeding, interference competition and phage, and build our framework using methods from statistical mechanics. Throughout, we will experimentally test our theory using the gut microbiota as a model system. We will address three fundamental questions: 1: What determines the composition and stability of communities? Theory will be parameterised with large-scale culturing on defined media, metabolomics and whole-genome metabolic models. We will empirically test our ability to predict composition and ecological stability, and to understand the diversity-stability relationship. 2: What determines ecological success? We will study what makes a strain successful within a community, incorporating metabolism, bacterial warfare, and phage predation. 3: How does the host environment shape microbial ecology? We will employ agent-based simulations to capture spatial structure and test them with a new in-vitro organoid model of the human gut mucosa and our new in-vivo imaging pipeline for mouse microbiomes. Our plans have risk because ecological systems are complex and hard to understand. However, our work promises to deliver a step-change in both ecology and microbiology by making the study of microbial communities a predictive science, where one can understand ahead-of-time how particular sets of species will behave as a system. Furthermore, we will help establish the ecological principles needed to rationally manipulate our own microbiomes.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne mikrobiologia wirusologia
- nauki przyrodnicze matematyka matematyka czysta matematyka dyskretna logika matematyczna
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne ekologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologiczne nauki behawioralne etologia zależności międzygatunkowe
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2024-ADG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
OX1 2JD Oxford
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.