Description du projet
Système de classification phylogénétique basé sur l’ADN pour les champignons
Le royaume des champignons compte plus de 150 000 espèces reconnues, avec des estimations de 2 à 3 millions au total. Les analyses préliminaires de l’ADN électronique suggèrent des taxons encore plus importants, mais les règles de dénomination actuelles ne permettent pas d’obtenir des descriptions basées sur l’ADN. Le projet PhylFun, financé par le CER, vise à créer un système de classification phylogénétique basé sur l’ADN, axé sur les champignons, afin d’améliorer la communication taxonomique. Utilisant des techniques avancées d’analyse unicellulaire, de génomique et de taxonomie, l’équipe analysera une collection mondiale d’échantillons pour une classification basée sur l’ADN et générera un cadre de classification complet. Il produira des données de séquençage d’ADN de haute qualité et de longue lecture, développera une plateforme bioinformatique pour une gestion efficace des données et fournira des noms et des classifications valides pour des champignons et autres micro-organismes jusqu’alors difficiles à identifier, ainsi que des informations sur leur rôle écologique et leurs besoins en matière de conservation.
Objectif
The kingdom Fungi comprises >150,000 currently recognised species distributed across 80 classes in 20 phyla. Total species numbers are estimated at 2-3 million and our preliminary eDNA analyses suggest at least double numbers of higher-ranking taxa. However, current nomenclatural regulations fall short in DNA-based taxonomic descriptions. PhylFun aims to develop the concept and methodology for DNA-based phylogenetic classification of organisms, using fungi as examples, for an improved taxon communication and classification framework.
My team will use cutting-edge methods of single-cell analysis, genomics and taxonomy for analysing our global collection of samples for DNA/sequence-based classification and providing a detailed higher-level fungal classification. We will generate large amounts of high-quality long-read DNA sequence data and create a bioinformatics platform for data management (WP1) that will be combined with the developed DNA-based classification framework (WP2) to produce an updated phylogenetic classification for fungi and potentially other microeukaryotes (WP3).
PhylFun is expected to greatly benefit researchers and the public by communicating the taxa of fungi and other eukaryotic microorganisms, allowing us to consider them in conservation assessments and quarantine. The project is of a high-risk high-gain (HRHG) nature because of multiple novel methodological aspects and addressing one of the greatest gaps in taxonomy and classification related to rapid technological advances, whereas the proposed amendments for using DNA/sequence characters as types or in descriptions/diagnoses may be voted down by morphotaxonomists. Nonetheless, the potential benefits for the entire taxonomic and research community can be enormous by finally anchoring the “dark matter” fungi and other microeukaryotic organisms via providing valid names, a position in the classification system, insights into potential ecophysiological functions and conservation requirements.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2024-ADG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
51005 TARTU
Estonie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.