Descrizione del progetto
Un sistema di classificazione filogenetica per i funghi basato sul DNA
Il regno dei funghi conta più di 150 000 specie riconosciute e 2 o 3 milioni di specie totali stimate. Le analisi preliminari dell’eDNA suggeriscono taxa di rango ancora più elevato, ma le attuali normative sulla denominazione non sono sufficienti per le descrizioni basate sul DNA. Il progetto PhylFun, finanziato dal CER, si propone di creare un sistema di classificazione filogenetica basato sul DNA, incentrato sui funghi, per migliorare la comunicazione tassonomica. Usando tecniche avanzate di analisi a livello di singola cellula, la genomica e la tassonomia, analizzerà una raccolta globale di campioni per la classificazione basata sul DNA e genererà un quadro di classificazione completo. Il progetto, inoltre, produrrà dati di sequenze di DNA di lunga durata di alta qualità, svilupperà una piattaforma bioinformatica per una gestione efficace dei dati e fornirà nomi e classificazioni validi per funghi e altri microrganismi precedentemente sfuggenti, insieme a informazioni sui loro ruoli ecologici e sulle esigenze di conservazione.
Obiettivo
The kingdom Fungi comprises >150,000 currently recognised species distributed across 80 classes in 20 phyla. Total species numbers are estimated at 2-3 million and our preliminary eDNA analyses suggest at least double numbers of higher-ranking taxa. However, current nomenclatural regulations fall short in DNA-based taxonomic descriptions. PhylFun aims to develop the concept and methodology for DNA-based phylogenetic classification of organisms, using fungi as examples, for an improved taxon communication and classification framework.
My team will use cutting-edge methods of single-cell analysis, genomics and taxonomy for analysing our global collection of samples for DNA/sequence-based classification and providing a detailed higher-level fungal classification. We will generate large amounts of high-quality long-read DNA sequence data and create a bioinformatics platform for data management (WP1) that will be combined with the developed DNA-based classification framework (WP2) to produce an updated phylogenetic classification for fungi and potentially other microeukaryotes (WP3).
PhylFun is expected to greatly benefit researchers and the public by communicating the taxa of fungi and other eukaryotic microorganisms, allowing us to consider them in conservation assessments and quarantine. The project is of a high-risk high-gain (HRHG) nature because of multiple novel methodological aspects and addressing one of the greatest gaps in taxonomy and classification related to rapid technological advances, whereas the proposed amendments for using DNA/sequence characters as types or in descriptions/diagnoses may be voted down by morphotaxonomists. Nonetheless, the potential benefits for the entire taxonomic and research community can be enormous by finally anchoring the “dark matter” fungi and other microeukaryotic organisms via providing valid names, a position in the classification system, insights into potential ecophysiological functions and conservation requirements.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia micologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2024-ADG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
51005 Tartu
Estonia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.