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Small RNAs in immunity and regulation of giant endogenous viral elements in eukaryotes

Descrizione del progetto

Immunità contro i virus giganti

I virus giganti sono virus a DNA di dimensioni insolite, spesso visibili al microscopio ottico, con genomi superiori a quelli di molti batteri. È dimostrato che i virus giganti possono integrarsi nel genoma di molte specie eucariotiche, formando elementi virali giganti endogeni (GEVE). Recentemente è stato scoperto che un parente unicellulare degli animali è portatore di centinaia di questi elementi. Normalmente silenziosi, i GEVE si riattivano quando la metilazione del DNA viene rimossa, portando all’espressione sia di sequenze virali che di quelle coinvolte nelle vie dei piccoli RNA (sRNA). Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto SMALLGIANT studia se i GEVE riattivati producono sRNA che contribuiscono alla difesa antivirale e riflettono la co-evoluzione con i virus giganti. I risultati del progetto faranno luce sull’immunità basata sull’RNA negli eucarioti unicellulari.

Obiettivo

In this project, we aim to investigate the role of small RNAs (sRNAs) in defending against giant virus infections. Giant viruses are eukaryotic viruses with exceptionally large genomes, some of which surpass the size of bacterial genomes. Remarkably, giant virus integrations have been found across various eukaryotes, leading to the formation of giant endogenous viral elements (GEVEs). Among the reported GEVEs, the host group (Dr. de Mendoza’s laboratory) has identified a unicellular relative of animals that harbours hundreds of GEVEs—more than any other known eukaryote. This observation suggests that these viral integrations may confer a beneficial role to the host. Although GEVEs are typically transcriptionally silent, the removal of DNA methylation triggers the reactivation of many viral genes, mimicking an infection. Notably, proteins related to sRNA biogenesis are upregulated during this reactivation, indicating that sRNAs may play a role in post-transcriptional silencing of the endogenized viruses, as no viral particles are formed. Based on these findings, we hypothesize that GEVE-derived transcripts generate sRNAs that help defend against future infections.To explore this hypothesis, I will bring my expertise in small RNAs to the host lab, aiming to deepen our understanding of how sRNAs co-evolved with GEVEs and how they may function in immunity against giant viruses. My focus will be on key unicellular eukaryotes that possess the genetic machinery necessary for sRNA processing and show evidence of containing GEVEs. The outcomes of this project have the potential to open a new field of research. If sRNAs are indeed involved in immunity, they could be leveraged to protect these species against new infections. Additionally, we propose various outreach activities to engage the public and highlight the importance of studying the evolution of unicellular eukaryotes and giant viruses.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

QUEEN MARY UNIVERSITY OF LONDON
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 276 187,92
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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