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Mutational atlas of dengue virus non-structural protein 1 (NS1) in cell culture and mosquitos: mapping infection at single-cell resolution

Descripción del proyecto

Rastrear la evolución del virus del dengue

El virus del dengue (DENV) es el arbovirus más prevalente en todo el mundo. Su rápida evolución complica los esfuerzos por controlarlo. La proteína no estructural 1 (NS1) desempeña un papel crucial en su replicación y transmisión, pero sus condicionantes evolutivos siguen siendo poco conocidos. Con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, el equipo del proyecto MOSAIC investigará el impacto de las variantes NS1 en la infección por DENV mediante un escaneo mutacional exhaustivo. Creará diversas poblaciones virales para estudiar su impacto en líneas celulares humanas y de mosquitos, para descubrir las presiones selectivas específicas del hospedador. Las infecciones de mosquitos «in vivo» ayudarán a mapear la distribución de las variantes NS1 y el transcriptoma del mosquito con una resolución unicelular. En el proyecto se dilucidará la evolución del DENV, los cuellos de botella en la transmisión y las interacciones con la inmunidad de los mosquitos.

Objetivo

Dengue virus (DENV) is the most prevalent arbovirus worldwide and its ability to rapidly evolve and adapt complicates efforts to control its spread. A key factor in the replication cycle of DENV is the multifunctional non-structural protein 1 (NS1), which is involved in viral replication, transmission, and pathogenesis. Despite its importance, the evolutionary constraints and host-specific functions of NS1 remain poorly understood.

To address this gap, I propose MOSAIC: a comprehensive approach to map the impact of NS1 variants on DENV infection. Using deep mutational scanning (DMS), I will generate diverse viral populations to assess the fitness effects of DENV NS1 variants in mosquito and human cell lines, uncovering host-specific selective pressures. These diverse populations will then be used for in vivo mosquito infection to generate a detailed atlas of NS1 variant distribution across mosquito cells and map the corresponding mosquito transcriptome at single-cell resolution. By combining my expertise in virus evolution with the leading work of the host lab on insect immunity, MOSAIC will uniquely integrate DMS and single-cell transcriptomics, establishing the foundation for novel ways to understand virus evolution at high resolution.

MOSAIC will reveal insights into the evolutionary constraints of DENV NS1, identify transmission bottlenecks in distinct mosquito organs and cell types, and explore the interaction between DENV and mosquito immunity. This work will advance our understanding of flavivirus biology and host-virus interactions from a novel perspective, informing the development of new vector control strategies, vaccines, and therapeutics to combat DENV and other arboviral diseases in line with EU global health priorities. Finally, MOSAIC will provide me with multidisciplinary training in advanced genomics, vector biology and bioinformatics, strengthening my expertise in infectious disease research and preparing me to become an independent researcher.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Coordinador

INSTITUT PASTEUR
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 226 420,56
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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