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Mutational atlas of dengue virus non-structural protein 1 (NS1) in cell culture and mosquitos: mapping infection at single-cell resolution

Description du projet

Suivre l’évolution du virus de la dengue

Le virus de la dengue (DENV) est l’arbovirus le plus répandu au monde. Son évolution rapide complique les efforts déployés pour la contrôler. La protéine non structurale 1 (NS1) joue un rôle crucial dans sa réplication et sa transmission, mais ses contraintes évolutives restent mal comprises. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet MOSAIC étudiera l’impact des variants NS1 sur l’infection par le virus de la dengue grâce à un balayage mutationnel approfondi. Il permettra de créer des populations virales diversifiées afin d’étudier leur impact sur les lignées cellulaires de moustiques et humaines, et de mettre en évidence les pressions de sélection spécifiques à l’hôte. Les infections in vivo chez les moustiques permettront de cartographier la distribution des variants NS1 et le transcriptome du moustique à l’échelle de la cellule unique. Ce projet permettra d’élucider l’évolution du virus de la dengue (DENV), les obstacles à sa transmission et ses interactions avec l’immunité des moustiques.

Objectif

Dengue virus (DENV) is the most prevalent arbovirus worldwide and its ability to rapidly evolve and adapt complicates efforts to control its spread. A key factor in the replication cycle of DENV is the multifunctional non-structural protein 1 (NS1), which is involved in viral replication, transmission, and pathogenesis. Despite its importance, the evolutionary constraints and host-specific functions of NS1 remain poorly understood.

To address this gap, I propose MOSAIC: a comprehensive approach to map the impact of NS1 variants on DENV infection. Using deep mutational scanning (DMS), I will generate diverse viral populations to assess the fitness effects of DENV NS1 variants in mosquito and human cell lines, uncovering host-specific selective pressures. These diverse populations will then be used for in vivo mosquito infection to generate a detailed atlas of NS1 variant distribution across mosquito cells and map the corresponding mosquito transcriptome at single-cell resolution. By combining my expertise in virus evolution with the leading work of the host lab on insect immunity, MOSAIC will uniquely integrate DMS and single-cell transcriptomics, establishing the foundation for novel ways to understand virus evolution at high resolution.

MOSAIC will reveal insights into the evolutionary constraints of DENV NS1, identify transmission bottlenecks in distinct mosquito organs and cell types, and explore the interaction between DENV and mosquito immunity. This work will advance our understanding of flavivirus biology and host-virus interactions from a novel perspective, informing the development of new vector control strategies, vaccines, and therapeutics to combat DENV and other arboviral diseases in line with EU global health priorities. Finally, MOSAIC will provide me with multidisciplinary training in advanced genomics, vector biology and bioinformatics, strengthening my expertise in infectious disease research and preparing me to become an independent researcher.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

INSTITUT PASTEUR
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 226 420,56
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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