Description du projet
Architecture et évolution du génome en 3D
La duplication des gènes est un mécanisme évolutif clé responsable de l’émergence de nouvelles fonctions et caractéristiques génétiques chez certaines espèces. À l’intérieur du noyau, l’ADN est replié en une structure 3D complexe qui façonne l’activité des gènes, mais son rôle dans l’évolution de nouvelles fonctions génétiques est encore mal compris. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet CHORDUP entend déterminer comment l’organisation 3D du génome chez les chordés influe sur la duplication des gènes. Les chercheurs établiront un atlas complet reliant les duplications de gènes à la séquence, à l’expression et aux caractéristiques spatiales du génome. Les résultats du projet permettront de mieux comprendre comment les gènes dupliqués naissent et évoluent dans leur contexte 3D.
Objectif
Inside the nucleus of each eukaryotic cell, DNA is intricately packed into a three-dimensional (3D) structure essential for gene regulation. However, its role in genome evolution, particularly in gene function innovation, remains largely unexplored. Gene duplication is the primary evolutionary path to gene function innovation. This project aims to investigate the interplay between gene duplication evolution and 3D genome structure in chordate genomes by comparing zebrafish to amphioxus, a non-vertebrate marine chordate that diverged from the rest of chordates about 500 million years ago. By generating, for the first time, 3D genome structure maps for several amphioxus organs, I will construct an atlas of gene duplications in zebrafish and amphioxus, encompassing sequence, synteny, gene expression, and 3D genome structure information. Leveraging the information encompassed in this atlas, I will investigate the intricate dynamics between the origin and evolutionary fate of chordate duplicated genes, emerged either by whole-genome or small-scale duplication, and the 3D genome structure around them. By combining my expertise in evolution of gene duplications and amphioxus genomics, with my host group’s experience in 3D genomic architecture and its evolution, we will be able to provide deep insight into the spatial mechanisms of gene innovation through duplication. Studying the effect of 3D genome structure across amphioxus and zebrafish organs in the context of gene duplications, will position me at the forefront of this emerging field within the comparative genomics community. Altogether, the results obtained will enhance our understanding of the evolution of new gene functions, and open new avenues for structural and evolutionary genomics.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
La classification de ce projet a été validée par des humains.
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La classification de ce projet a été validée par des humains.
Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
08193 Cerdanyola Del Valles
Espagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.