Projektbeschreibung
3D-Genomarchitektur und Evolution
Die Genduplikation ist ein wichtiger evolutionärer Mechanismus, der bei einigen Arten für die Entstehung neuer Genfunktionen und -merkmale verantwortlich ist. Innerhalb des Zellkerns ist die DNS zu einer komplexen 3D-Struktur gefaltet, die die Genaktivität prägt, aber deren Rolle in der Evolution neuer Genfunktionen ist nicht umfassend erforscht. Das Ziel des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts CHORDUP besteht darin, genauer zu beschreiben, wie sich die 3D-Genomorganisation bei Chordatieren auf die Genduplikation auswirkt. Die Forschenden werden einen umfassenden Atlas erstellen, der Genduplikationen mit Sequenz-, Expressions- und räumlichen Genommerkmalen verknüpft. Die Projektergebnisse werden unser Verständnis darüber verbessern, wie duplizierte Gene entstehen und sich innerhalb ihres 3D-Kontexts weiterentwickeln.
Ziel
Inside the nucleus of each eukaryotic cell, DNA is intricately packed into a three-dimensional (3D) structure essential for gene regulation. However, its role in genome evolution, particularly in gene function innovation, remains largely unexplored. Gene duplication is the primary evolutionary path to gene function innovation. This project aims to investigate the interplay between gene duplication evolution and 3D genome structure in chordate genomes by comparing zebrafish to amphioxus, a non-vertebrate marine chordate that diverged from the rest of chordates about 500 million years ago. By generating, for the first time, 3D genome structure maps for several amphioxus organs, I will construct an atlas of gene duplications in zebrafish and amphioxus, encompassing sequence, synteny, gene expression, and 3D genome structure information. Leveraging the information encompassed in this atlas, I will investigate the intricate dynamics between the origin and evolutionary fate of chordate duplicated genes, emerged either by whole-genome or small-scale duplication, and the 3D genome structure around them. By combining my expertise in evolution of gene duplications and amphioxus genomics, with my host group’s experience in 3D genomic architecture and its evolution, we will be able to provide deep insight into the spatial mechanisms of gene innovation through duplication. Studying the effect of 3D genome structure across amphioxus and zebrafish organs in the context of gene duplications, will position me at the forefront of this emerging field within the comparative genomics community. Altogether, the results obtained will enhance our understanding of the evolution of new gene functions, and open new avenues for structural and evolutionary genomics.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
08193 Cerdanyola Del Valles
Spanien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.