Descrizione del progetto
Architettura ed evoluzione del genoma 3D
La duplicazione genica è un meccanismo evolutivo chiave responsabile dell’emergere di nuove funzioni e tratti genici in alcune specie. All’interno del nucleo, il DNA è ripiegato in una complessa struttura 3D che modella l’attività dei geni, ma il suo ruolo nell’evoluzione di nuove funzioni geniche non è ben compreso. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto CHORDUP intende illustrare come l’organizzazione tridimensionale del genoma nei cordati influisca sulla duplicazione genica. I ricercatori costruiranno un atlante completo che collega le duplicazioni geniche alla sequenza, all’espressione e alle caratteristiche spaziali del genoma. I risultati del progetto miglioreranno la nostra comprensione di come i geni duplicati si originano ed evolvono nel loro contesto 3D.
Obiettivo
Inside the nucleus of each eukaryotic cell, DNA is intricately packed into a three-dimensional (3D) structure essential for gene regulation. However, its role in genome evolution, particularly in gene function innovation, remains largely unexplored. Gene duplication is the primary evolutionary path to gene function innovation. This project aims to investigate the interplay between gene duplication evolution and 3D genome structure in chordate genomes by comparing zebrafish to amphioxus, a non-vertebrate marine chordate that diverged from the rest of chordates about 500 million years ago. By generating, for the first time, 3D genome structure maps for several amphioxus organs, I will construct an atlas of gene duplications in zebrafish and amphioxus, encompassing sequence, synteny, gene expression, and 3D genome structure information. Leveraging the information encompassed in this atlas, I will investigate the intricate dynamics between the origin and evolutionary fate of chordate duplicated genes, emerged either by whole-genome or small-scale duplication, and the 3D genome structure around them. By combining my expertise in evolution of gene duplications and amphioxus genomics, with my host group’s experience in 3D genomic architecture and its evolution, we will be able to provide deep insight into the spatial mechanisms of gene innovation through duplication. Studying the effect of 3D genome structure across amphioxus and zebrafish organs in the context of gene duplications, will position me at the forefront of this emerging field within the comparative genomics community. Altogether, the results obtained will enhance our understanding of the evolution of new gene functions, and open new avenues for structural and evolutionary genomics.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
08193 Cerdanyola Del Valles
Spagna
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.