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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Dissecting long non-coding RNA function using in vivo synthetic biology

Descripción del proyecto

El papel de los ARN no codificantes largos en la regulación génica

Durante el desarrollo embrionario, los genes deben activarse y desactivarse en el momento y lugar adecuados para garantizar un crecimiento correcto. Los ARN no codificantes largos (lncARN) desempeñan un papel fundamental en este proceso, pero su función en los organismos vivos sigue siendo en gran medida sin analizarse. La mayoría de los estudios se basan en experimentos de laboratorio, que no reflejan plenamente el funcionamiento de los lncARN en sistemas biológicos complejos, por lo que resulta difícil determinar su función exacta. El equipo del proyecto SynLncRNAs, que cuenta con el apoyo de las Acciones Marie Skłodowska-Curie, aborda este reto investigando el lncARN Maenli, que regula un gen específico durante el desarrollo embrionario de los ratones. En el proyecto se pretende desvelar el funcionamiento de Maenli, lo que aportará nuevos conocimientos sobre la regulación génica con implicaciones para la investigación de enfermedades y la biotecnología.

Objetivo

Precise spatiotemporal regulation of gene expression is essential for healthy embryonic development. Long non-coding RNAs (lncRNAs) contribute to the regulation of gene expression. However, our current understanding of lncRNAs derives mostly from in vitro studies, with little known about their function in vivo. The core aim of this action is to dissect mechanisms of gene regulation by lncRNAs in vivo. The lncRNA Maenli is a perfect model to gain insight into lncRNA function as it activates a specific target gene in a tissue-specific manner during mouse embryonic development. This enables a quantitative in vivo read-out without compounding genome-wide effects. My hypothesis is that Maenli function is restricted to its 3D chromatin domain where it activates its target gene through transcription-associated processes, and not via the mature lncRNA transcript. To test this, I require methods that enable manipulation of the entire ~25kb locus and site-specific insertion in the genome. I will use cutting-edge synthetic biology to re-construct and manipulate Maenli, insert it in specific genomic regions, and examine its effect on target gene expression and phenotype in the mouse embryo. I will use low-input CUT&RUN to assess the functional chromatin state associated with Maenli. This interdisciplinary approach will go beyond the state of the art to illuminate specific mechanisms of cis-acting lncRNA function in vivo. This has not been possible until now due to technical limitations in conventional gene editing and challenges associated with studying lncRNAs in vivo. I anticipate that SynLncRNAs will set a new standard to study lncRNA function in vivo; impacting fundamental, disease and evolutionary research on gene regulation, as well as society and education. With expertise in the non-coding genome and in vivo synthetic biology, the Mundlos laboratory is the perfect environment for me to execute this action and train to become an independent group leader in the future.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 202 125,12
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos
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