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Dissecting long non-coding RNA function using in vivo synthetic biology

Description du projet

Le rôle des ARNlnc dans la régulation des gènes

Au cours du développement embryonnaire, les gènes doivent être activés et désactivés au bon moment et au bon endroit pour assurer une croissance adéquate. Les longs ARN non codants (ARNlnc) jouent un rôle essentiel dans ce processus, mais leur fonction dans les organismes vivants demeure largement inexplorée. La plupart des études reposent sur des expériences en laboratoire, qui ne rendent pas pleinement compte du fonctionnement des ARNlnc dans des systèmes biologiques complexes, et leur rôle précis est par conséquent difficile à déterminer. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet SynLncRNAs aborde ce problème en étudiant l’ARNlnc Maenli, qui régule un gène spécifique au cours du développement embryonnaire de la souris. Le projet entend faire la lumière le fonctionnement de Maenli, afin de mieux comprendre la régulation des gènes, contribuant ainsi à la recherche sur les maladies et à la biotechnologie.

Objectif

Precise spatiotemporal regulation of gene expression is essential for healthy embryonic development. Long non-coding RNAs (lncRNAs) contribute to the regulation of gene expression. However, our current understanding of lncRNAs derives mostly from in vitro studies, with little known about their function in vivo. The core aim of this action is to dissect mechanisms of gene regulation by lncRNAs in vivo. The lncRNA Maenli is a perfect model to gain insight into lncRNA function as it activates a specific target gene in a tissue-specific manner during mouse embryonic development. This enables a quantitative in vivo read-out without compounding genome-wide effects. My hypothesis is that Maenli function is restricted to its 3D chromatin domain where it activates its target gene through transcription-associated processes, and not via the mature lncRNA transcript. To test this, I require methods that enable manipulation of the entire ~25kb locus and site-specific insertion in the genome. I will use cutting-edge synthetic biology to re-construct and manipulate Maenli, insert it in specific genomic regions, and examine its effect on target gene expression and phenotype in the mouse embryo. I will use low-input CUT&RUN to assess the functional chromatin state associated with Maenli. This interdisciplinary approach will go beyond the state of the art to illuminate specific mechanisms of cis-acting lncRNA function in vivo. This has not been possible until now due to technical limitations in conventional gene editing and challenges associated with studying lncRNAs in vivo. I anticipate that SynLncRNAs will set a new standard to study lncRNA function in vivo; impacting fundamental, disease and evolutionary research on gene regulation, as well as society and education. With expertise in the non-coding genome and in vivo synthetic biology, the Mundlos laboratory is the perfect environment for me to execute this action and train to become an independent group leader in the future.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Voir tous les projets financés au titre de cet appel

Coordinateur

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 202 125,12
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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