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Dissecting long non-coding RNA function using in vivo synthetic biology

Descrizione del progetto

Il ruolo degli IncRNA nella regolazione genica

Durante lo sviluppo embrionale, i geni devono essere attivati e disattivati al momento e al posto giusto per garantire una crescita corretta. Gli RNA lunghi non codificanti (lncRNA) svolgono un ruolo chiave in questo processo ma la loro funzione negli organismi viventi rimane in gran parte inesplorata. La maggior parte degli studi si basa su esperimenti di laboratorio, che non colgono appieno il funzionamento degli lncRNA in sistemi biologici complessi, rendendo difficile determinarne il ruolo preciso. Il progetto SynLncRNAs, sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, affronta questa sfida studiando l’lncRNA Maenli, che regola un gene specifico durante lo sviluppo embrionale del topo. Il progetto si propone di svelare il funzionamento di Maenli, fornendo nuove conoscenze sulla regolazione genica con implicazioni per la ricerca sulle malattie e la biotecnologia.

Obiettivo

Precise spatiotemporal regulation of gene expression is essential for healthy embryonic development. Long non-coding RNAs (lncRNAs) contribute to the regulation of gene expression. However, our current understanding of lncRNAs derives mostly from in vitro studies, with little known about their function in vivo. The core aim of this action is to dissect mechanisms of gene regulation by lncRNAs in vivo. The lncRNA Maenli is a perfect model to gain insight into lncRNA function as it activates a specific target gene in a tissue-specific manner during mouse embryonic development. This enables a quantitative in vivo read-out without compounding genome-wide effects. My hypothesis is that Maenli function is restricted to its 3D chromatin domain where it activates its target gene through transcription-associated processes, and not via the mature lncRNA transcript. To test this, I require methods that enable manipulation of the entire ~25kb locus and site-specific insertion in the genome. I will use cutting-edge synthetic biology to re-construct and manipulate Maenli, insert it in specific genomic regions, and examine its effect on target gene expression and phenotype in the mouse embryo. I will use low-input CUT&RUN to assess the functional chromatin state associated with Maenli. This interdisciplinary approach will go beyond the state of the art to illuminate specific mechanisms of cis-acting lncRNA function in vivo. This has not been possible until now due to technical limitations in conventional gene editing and challenges associated with studying lncRNAs in vivo. I anticipate that SynLncRNAs will set a new standard to study lncRNA function in vivo; impacting fundamental, disease and evolutionary research on gene regulation, as well as society and education. With expertise in the non-coding genome and in vivo synthetic biology, the Mundlos laboratory is the perfect environment for me to execute this action and train to become an independent group leader in the future.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 202 125,12
Indirizzo
HOFGARTENSTRASSE 8
80539 MUNCHEN
Germania

Mostra sulla mappa

Regione
Bayern Oberbayern München, Kreisfreie Stadt
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato
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