Description du projet
Les moteurs écologiques de la résistance aux antibiotiques
La résistance aux antibiotiques (RA) est un problème croissant, en grande partie dû au transfert de gènes de résistance entre bactéries. Ce phénomène se produit principalement par transfert horizontal de gènes (HGT pour «horizontal gene transfer»), un processus par lequel les bactéries échangent du matériel génétique. L’HGT est traditionnellement étudié en laboratoire, mais en réalité, il se produit plus fréquemment au sein des communautés microbiennes complexes de l’intestin humain. Bien que ces interactions écologiques puissent influencer de manière significative le transfert de gènes, leur validation expérimentale reste limitée. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet hTARGET entend examiner comment la dynamique des communautés bactériennes affecte le transfert des gènes de la RA. Les résultats du projet permettront de mieux comprendre l’évolution de la résistance et de concevoir de nouvelles stratégies pour lutter contre la RA en milieu clinique et environnemental.
Objectif
Horizontal Gene Transfer (HGT) stands among the most common mechanisms for the emergence and persistence of Antibiotic Resistance (AR) in microbial communities, a major challenge in medicine and agriculture. While molecular mechanisms driving HGT are typically studied through in vitro co-cultures of two species, a donor and an acceptor species, HGT occurs in nature within microbial communities (such as the human gut microbiome) in which such two species interact with many others. Metagenomics has identified these ecological interactions as potential catalysts for HGT, yet direct experimental evidence remains lacking.
This project aims to elucidate how ecological interactions drive HGT of AR genes in diverse bacterial communities by combining experiments and theoretical models. Recent experimental advances have enabled the ecological interrogation of highly diverse communities in vitro, while theoretical models, inspired by statistical physics, can disentangle the dominant ecological interactions and predict the community dynamics. I will use high-throughput, in vitro techniques to assemble hundreds of different synthetic communities in which we will measure the rates of HGT of AR genes, both in the presence and absence of antibiotic exposure. I will develop a novel theoretical model that incorporates species interactions, environmental context and HGT. Utilizing statistical physics tools, I will generate testable predictions capable of interpreting the experimental outcomes. The project aims to generate a novel, quantitative understanding of how ecology modulates the HGT of AR genes, bridging the gap between molecular mechanisms previously described in pairwise co-cultures and ecological trends inferred from metagenomics. This knowledge will not only lead to the development of a theoretical framework integrating community ecology and HGT but also has the potential to indicate new strategies for addressing the global antibiotic resistance crisis.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences sociales autres sciences sociales études de développement développements sociaux
- sciences naturelles sciences biologiques écologie
- sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
- sciences naturelles sciences chimiques catalyse
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75794 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.