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Unveiling the role of Ecological Interactions in Antibiotic Resistance Evolution via Horizontal Gene Transfer

Projektbeschreibung

Ökologische Triebkräfte von Antibiotikaresistenz

Antibiotikaresistenz stellt ein wachsendes Problem dar, das weitgehend durch die Übertragung von Resistenzgenen zwischen Bakterien verursacht wird. Dies geschieht hauptsächlich durch horizontalen Gentransfer, einen Prozess, in dessen Verlauf Bakterien genetisches Material austauschen. Horizontaler Gentransfer wird traditionell im Labor untersucht, aber in Wirklichkeit findet er häufiger in den komplizierten mikrobiellen Gemeinschaften des menschlichen Darms statt. Obwohl diese ökologischen Wechselwirkungen den Gentransfer erheblich beeinflussen können, ist die experimentelle Validierung bisher eher begrenzt. Das Ziel des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts hTARGET besteht darin, zu untersuchen, wie die Dynamik bakterieller Gemeinschaften den Transfer der Antibiotikaresistenzgene beeinflusst. Die Projektergebnisse werden unser Verständnis der Resistenzevolution verbessern und dazu beitragen, neue Strategien zur Bekämpfung von Antibiotikaresistenzen im klinischen Umfeld und in der Umwelt zu erarbeiten.

Ziel

Horizontal Gene Transfer (HGT) stands among the most common mechanisms for the emergence and persistence of Antibiotic Resistance (AR) in microbial communities, a major challenge in medicine and agriculture. While molecular mechanisms driving HGT are typically studied through in vitro co-cultures of two species, a donor and an acceptor species, HGT occurs in nature within microbial communities (such as the human gut microbiome) in which such two species interact with many others. Metagenomics has identified these ecological interactions as potential catalysts for HGT, yet direct experimental evidence remains lacking.
This project aims to elucidate how ecological interactions drive HGT of AR genes in diverse bacterial communities by combining experiments and theoretical models. Recent experimental advances have enabled the ecological interrogation of highly diverse communities in vitro, while theoretical models, inspired by statistical physics, can disentangle the dominant ecological interactions and predict the community dynamics. I will use high-throughput, in vitro techniques to assemble hundreds of different synthetic communities in which we will measure the rates of HGT of AR genes, both in the presence and absence of antibiotic exposure. I will develop a novel theoretical model that incorporates species interactions, environmental context and HGT. Utilizing statistical physics tools, I will generate testable predictions capable of interpreting the experimental outcomes. The project aims to generate a novel, quantitative understanding of how ecology modulates the HGT of AR genes, bridging the gap between molecular mechanisms previously described in pairwise co-cultures and ecological trends inferred from metagenomics. This knowledge will not only lead to the development of a theoretical framework integrating community ecology and HGT but also has the potential to indicate new strategies for addressing the global antibiotic resistance crisis.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 226 420,56
Adresse
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Frankreich

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Region
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

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