Descrizione del progetto
I fattori ecologici della resistenza agli antibiotici
La resistenza agli antibiotici (AR) è un problema crescente, per lo più mediato dal trasferimento dei geni di resistenza tra i batteri. Ciò avviene principalmente attraverso il trasferimento genico orizzontale (HGT), un processo in cui i batteri si scambiano materiale genetico. L’HGT è stato tradizionalmente studiato in laboratorio, ma nella realtà è all’interno delle complesse comunità microbiche dell’intestino umano che avviene con più frequenza. Sebbene queste interazioni ecologiche possano influire notevolmente sul trasferimento genico, la convalida sperimentale è ancora limitata. Con il supporto del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto hTARGET intende studiare come le dinamiche delle comunità batteriche influiscano sul trasferimento dei geni AR. I risultati del progetto ci aiuteranno a comprendere meglio l’evoluzione della resistenza e contribuiranno alla progettazione di nuove strategie per affrontare l’AR in ambito clinico e ambientale.
Obiettivo
Horizontal Gene Transfer (HGT) stands among the most common mechanisms for the emergence and persistence of Antibiotic Resistance (AR) in microbial communities, a major challenge in medicine and agriculture. While molecular mechanisms driving HGT are typically studied through in vitro co-cultures of two species, a donor and an acceptor species, HGT occurs in nature within microbial communities (such as the human gut microbiome) in which such two species interact with many others. Metagenomics has identified these ecological interactions as potential catalysts for HGT, yet direct experimental evidence remains lacking.
This project aims to elucidate how ecological interactions drive HGT of AR genes in diverse bacterial communities by combining experiments and theoretical models. Recent experimental advances have enabled the ecological interrogation of highly diverse communities in vitro, while theoretical models, inspired by statistical physics, can disentangle the dominant ecological interactions and predict the community dynamics. I will use high-throughput, in vitro techniques to assemble hundreds of different synthetic communities in which we will measure the rates of HGT of AR genes, both in the presence and absence of antibiotic exposure. I will develop a novel theoretical model that incorporates species interactions, environmental context and HGT. Utilizing statistical physics tools, I will generate testable predictions capable of interpreting the experimental outcomes. The project aims to generate a novel, quantitative understanding of how ecology modulates the HGT of AR genes, bridging the gap between molecular mechanisms previously described in pairwise co-cultures and ecological trends inferred from metagenomics. This knowledge will not only lead to the development of a theoretical framework integrating community ecology and HGT but also has the potential to indicate new strategies for addressing the global antibiotic resistance crisis.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze sociali altre scienze sociali studi sullo sviluppo sviluppi sociali
- scienze naturali scienze biologiche ecologia
- scienze agricole agricoltura, silvicoltura e pesca agricoltura
- scienze naturali scienze chimiche catalisi
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
75794 PARIS
Francia
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.