Descrizione del progetto
Studiare le origini dei primi coloni del Sud America
Si avverte la mancanza di metodi accurati per ricostruire gli aplotipi ancestrali delle popolazioni soggette a colli di bottiglia. Comprendere le origini delle varianti deleterie ad alta frequenza è fondamentale per affrontare i tassi più elevati di malattie genetiche in queste popolazioni e migliorare la consulenza genetica e gli sforzi di sanità pubblica. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MINERVA svilupperà metodi computazionali per stabilire il numero minimo di individui necessari a spiegare la diversità genetica nelle popolazioni che hanno subito colli di bottiglia notevoli. Il progetto, sfruttando le regioni genomiche non ricombinanti, il cromosoma Y e il DNA mitocondriale, consentirà di ricostruire accuratamente gli aplotipi autosomici. Questa ricerca si concentrerà sul Sud America, coinvolgendo la comunità Inga, per scoprire l’ascendenza genetica dei primi coloni del continente.
Obiettivo
In this project, MINERVA (Minimal Individual for Explaining Root Variation in Ancestry), I will craft novel computational methods to infer the minimal number of individuals required to explain the genetic diversity in populations that underwent severe bottlenecks. Through a scalable algorithmic framework, MINERVA will enable accurate autosomal haplotype reconstructions. We will leverage non-recombining genome regions, the Y chromosome, and mitochondrial DNA, inherited paternally and maternally, respectively. This will be reconciled with the autosomal phylogenies to provide a complete view of population dynamics across recombining and non-recombining genomic regions. With a new dataset from South America, this project will illuminate the genetic ancestry of the continent’s first settlers. While initially focusing on South America, MINERVA will be applicable to other bottlenecked populations, such as those in Greenland, the Faroe Islands, and Sardinia.
Currently, no accurate methods exist for reconstructing ancestral haplotypes in bottlenecked populations, which is essential for determining whether high-frequency deleterious variants are inherited from ancestral haplotypes, arose through selection, are de novo mutations, or were introduced through admixture. This research will advance our understanding of population-specific genetic variation and improve the accuracy of genome-wide association studies and polygenic risk scores. Bottlenecked populations often have higher rates of genetic diseases, and our work will offer critical insights into their origins and transmission, with implications for genetic counseling and public health.
During a secondment, I will collaborate with the Wuasikamas organization in southern Colombia to ensure cultural relevance. By engaging with the Inga community, I will present findings and foster a reciprocal exchange of knowledge, ensuring the research respects and benefits the communities involved.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche morfologia biochimica morfologia comparativa
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione scienze computazionali
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1165 KOBENHAVN
Danimarca
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.