Description du projet
L’impact des anticorps spécifiques aux Env HERV sur les maladies complexes
Les rétrovirus endogènes humains (HERV) sont des vestiges d’anciennes infections virales, dont les protéines d’enveloppe (Env) anormales des HERV sont liées au cancer, aux maladies auto-immunes et aux infections. Leur rôle exact et leur valeur pronostique ne sont toutefois toujours pas clairs. Soutenu par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet ENVISAGE va développer une plateforme permettant de rechercher les anticorps spécifiques l’ENV HERV et d’identifier les insertions des HERV produisant ces protéines. Il produira des lignées cellulaires HEK293T pour mesurer les niveaux d’anticorps chez les patients atteints de cancer et de maladies auto-immunes, tout en tenant compte des facteurs démographiques. Le projet établira également une référence pangénomique pour les séquences des HERV, utilisera le séquençage ciblé pour identifier les insertions actives et analysera des ensembles de données publiques pour évaluer l’impact de l’expression de l’Env HERV sur la progression de la maladie.
Objectif
Human endogenous retroviruses (HERV) are highly repetitive sequences that are remnants of viral infections successfully integrated in the genome. Aberrant expression of HERV envelope (Env) proteins is frequent in cancer, autoimmunity, neurodegeneration, and infection and has been associated with antibody responses. However, we do not know if all HERV Env proteins contribute to antibody responses or what the prognostic impact of HERV Env-specific antibodies is. Thus, the objectives of this proposal are to i) implement a high-throughput screening platform for HERV Env-specific antibodies and ii) develop a bioinformatics approach to identify the HERV insertions producing Env proteins. To achieve these goals, HEK293T cell lines overexpressing 10 different HERV Env proteins will be generated and used to quantify the abundance of Env-specific antibodies in serum from thousands of cancer, autoimmunity, and infection patients. With this work, we will determine if antibody responses to Env proteins are disease-specific and evaluate the impact of sex, age, and ethnicity on Env antibody titres. Following this, we will build a pangenome reference of HERV sequences in the human population to evaluate the polymorphism of HERV insertions. This database of HERV insertions will be used in combination with highly targeted sequencing (Amplicon-seq) and epigenomics to precisely identify the HERV insertions that are active in pathologies and produce Env proteins. Finally, we will analyse publicly available datasets to evaluate the impact of HERV Env expression on disease progression and survival. In addition to deepening our understanding of several human pathologies, this work could have important impacts on the diagnosis and treatment of complex human diseases.t
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences sociales sociologie anthropologie ethnologie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pathologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
NW1 1AT London
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.