Descrizione del progetto
L’impatto degli anticorpi specifici per HERV Env sulle malattie complesse
I retrovirus endogeni umani (HERV) sono residui di infezioni virali passate. Le proteine anomale dell’involucro degli HERV (Env) sono associate al cancro, alle malattie autoimmuni e alle infezioni, ma il loro ruolo esatto e il loro valore prognostico non sono ancora stati chiariti. Con il sostegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto ENVISAGE svilupperà una piattaforma per lo screening di anticorpi specifici per HERV Env e l’identificazione delle inserzioni HERV che producono queste proteine. A tal fine, genererà linee cellulari HEK293T per misurare i livelli di anticorpi nei pazienti con cancro e malattie autoimmuni, tenendo conto dei fattori demografici. Il progetto stabilirà anche un riferimento pan-genomico per le sequenze HERV, userà il sequenziamento mirato per identificare le inserzioni attive e analizzerà i set di dati pubblici per valutare l’impatto dell’espressione di HERV Env sulla progressione della malattia.
Obiettivo
Human endogenous retroviruses (HERV) are highly repetitive sequences that are remnants of viral infections successfully integrated in the genome. Aberrant expression of HERV envelope (Env) proteins is frequent in cancer, autoimmunity, neurodegeneration, and infection and has been associated with antibody responses. However, we do not know if all HERV Env proteins contribute to antibody responses or what the prognostic impact of HERV Env-specific antibodies is. Thus, the objectives of this proposal are to i) implement a high-throughput screening platform for HERV Env-specific antibodies and ii) develop a bioinformatics approach to identify the HERV insertions producing Env proteins. To achieve these goals, HEK293T cell lines overexpressing 10 different HERV Env proteins will be generated and used to quantify the abundance of Env-specific antibodies in serum from thousands of cancer, autoimmunity, and infection patients. With this work, we will determine if antibody responses to Env proteins are disease-specific and evaluate the impact of sex, age, and ethnicity on Env antibody titres. Following this, we will build a pangenome reference of HERV sequences in the human population to evaluate the polymorphism of HERV insertions. This database of HERV insertions will be used in combination with highly targeted sequencing (Amplicon-seq) and epigenomics to precisely identify the HERV insertions that are active in pathologies and produce Env proteins. Finally, we will analyse publicly available datasets to evaluate the impact of HERV Env expression on disease progression and survival. In addition to deepening our understanding of several human pathologies, this work could have important impacts on the diagnosis and treatment of complex human diseases.t
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze sociali sociologia antropologia etnologia
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze mediche e della salute medicina di base patologia
- scienze naturali scienze biologiche genetica epigenetica
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
NW1 1AT London
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.