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Spliceosomal Processes in Nucleomorphs

Descrizione del progetto

Uso dei nucleomorfi nell’espressione genica in situ

I nucleomorfi sono compatti e accessibili, e dunque ideali per studi efficienti in situ senza la necessità di una preparazione complessa del campione. Queste minuscole strutture potrebbero rivoluzionare le conoscenze sull’evoluzione del genoma eucariotico e dei processi nucleari. Con il sotegno del programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto SPiN farà leva sulle caratteristiche speciali dei nucleomorfi per approfondire l’architettura nucleare e l’espressione genica in situ. Attraverso tecniche di microscopia elettronica criogenica (crio-ME), tra cui la tomografia e l’analisi di singole particelle, il progetto studierà lo splicing del pre-mRNA nel contesto della riduzione del genoma. Stabilendo che i nucleomorfi sono sistemi modello efficaci per la ricerca in situ, SPiN chiarisce l’organizzazione nucleare e lo splicing, con implicazioni di vasta portata per la biologia evolutiva, la biologia cellulare e la biotecnologia.

Obiettivo

"The ""Splicing Processes in Nucleomorphs"" (SPiN) project leverages the unique properties of nucleomorphs to explore in situ the nuclear architecture and gene expression at an unprecedented level.

Using cutting-edge cryogenic electron microscopy (cryo-EM) techniques such as tomography, subtomogram averaging and single particle analysis, I want to provide novel understanding of how pre-mRNA splicing happens in the context of genome reduction. I will overcome the limitations of current cryo-ET studies of the nucleus that struggle with the large size and dense environment of typical eukaryotic nuclei. Nucleomorphs, with their small size, enable a more accessible and efficient approach to in situ studies, bypassing the need for complex sample preparation steps.

The SPiN project is structured around three specific aims: (1) isolating intact nucleomorphs for comprehensive proteomics and transcriptomics and structural analysis, (2) purifying and structurally characterizing spliceosome complexes unique to nucleomorphs, and (3) visualizing the structural landscape of nucleomorphs to understand the spatial organization of gene expression targeting spliceosome structures for in situ structural determination.

By establishing nucleomorphs as a powerful model for in situ studies, this project promises to uncover new insights into pre-mRNA splicing mechanisms and nuclear organization, with far-reaching implications across evolutionary biology, cell biology, and biotechnology. The potential for groundbreaking discoveries positions nucleomorphs as a transformative tool to advance our understanding of eukaryotic genome evolution and the mechanisms underlying nuclear processes."

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-PF-01

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Coordinatore

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contributo netto dell'UE
€ 242 260,56
Indirizzo
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Germania
Regione
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato