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The role of cell type-specific timing in the robustness of development

Projektbeschreibung

Wie der richtige Zeitpunkt eine zuverlässige Entwicklung prägt

Die Entwicklung von Embryonen ist bemerkenswert präzise, da die Gene in einer sorgfältig abgestimmten Reihenfolge aktiviert werden, um jeden Zelltyp zu bilden. Dieses Timing stellt sicher, dass das Wachstum stabil und koordiniert verläuft. Das vom Europäischen Forschungsrat finanzierte TIMERR-Projekt untersucht, wie Unterschiede in der Entwicklungsgeschwindigkeit zwischen Zelltypen diese Zuverlässigkeit beeinflussen. Durch die Verbindung fortschrittlicher Einzelzellgenomik mit Studien an zwei Modellarten, dem schnell wachsenden Zebrafisch und dem sich langsamer entwickelnden Medaka, wird das Projekt kartieren, wie die Zeitplanung zwischen den Arten und Geweben variiert. Mithilfe von Experimenten, bei denen das Entwicklungstempo angepasst wird, will TIMERR herausfinden, wie das Wachstum von Embryonen ausgeglichen und reproduzierbar bleibt, und so neue Erkenntnisse über einen der grundlegendsten Prozesse der Biologie gewinnen.

Ziel

Reproducibility in development is maintained via precisely-timed execution of gene regulatory programs required to build all cell types of the embryo. However, many perturbations challenge this robustness and accelerate developmental tempo, leading to increased phenotypic variability. Mechanisms underlying this century-old observation have been obscured by variation inherent to embryogenesis, but advances in statistical single-cell profiling have revealed an unappreciated source of variability: non-uniform progression of development across cell types. Here, I propose to use a combination of ultra-scalable single-cell genomics, cross-species alignment of developmental trajectories, and engineering of developmental rate to understand how cell type-specific timing differences influence reproducibility of development. First, comparing vertebrate species with natural tempo differences, fast-developing zebrafish (Danio rerio) and slow-developing medaka (Oryzias latipes), we aim to generate time-resolved single-cell transcriptomic profiles and map variation in cell type-specific timing. We will relate timing variation to a quantitative robustness measure derived from cell composition profiles for hundreds of embryos, asking how the tempo of development influences its ability to reproducibly build a well-proportioned animal. Second, we aim to identify cell type-specific drivers of timing and coordination. Specifically, we will modulate tempo embryo-wide and test for proportional timing changes across cells by tracking responses to perturbation at the cell type level. We will then use genetic tools to promote lineage-specific acceleration of development, assessing the embryo’s capacity to compensate for an induced asynchrony. In challenging coordinated developmental progression in evolutionary, perturbation, and synthetic contexts, we will resolve how timing impacts reproducibility in development.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-STG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 1 648 555,00
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Deutschland

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Region
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 1 648 555,00

Begünstigte (1)

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