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Transposable Elements as Architects Shaping Embryonic development

Description du projet

Éléments génétiques mobiles dans le développement embryonnaire

Le développement embryonnaire est régi par une expression génétique étroitement coordonnée. Cependant, cela ne semble pas suffire à expliquer la progression du développement. Les éléments transposables (ET) sont des éléments génétiques mobiles qui constituent environ la moitié du génome des mammifères. Les ET sont impliqués dans le développement précoce, mais leur rôle après l’implantation de l’embryon reste mal compris. Le projet TEASEr, financé par le CER, étudiera comment les ET contribuent au développement physiologique et pathologique de l’embryon. L’équipe de recherche utilisera l’ingénierie génomique avancée, le séquençage à haute résolution et l’imagerie dans les embryons et les modèles de cellules souches pour étudier comment les ET sont activés ou désactivés au cours de la différenciation cellulaire et comment ils conduisent la formation des tissus.

Objectif

The formation of a functional embryo is dictated by precise genetic and morphogenetic events. Yet, focusing solely on gene expression does not seem sufficient to explain all developmental phenotypes. Mobile genetic elements (or transposable elements, TEs) have been little studied in the context of cellular differentiation and organogenesis. I propose that TEs contribute to embryo formation, both in physiological and pathological contexts.

Nearly all eukaryotic genomes contain TEs, which account for roughly half of the mammalian genome. TEs are involved in early pre-implantation development as well as pathologies such as cancer and aging, but their role in the post-implantation embryo is unclear. This is in part due to technical challenges that can now be overcome with advances in genome engineering and long-read sequencing. I recently described that the aberrant expression of a TE during mouse limb development leads to the production of toxic viral-like particles (VLPs), causing a pathological phenotype. Mechanistically, this involves the TE using local gene regulation for its own transcription in specific developmental cells. These findings provoke emerging concepts on how TEs can disrupt or participate in embryo formation which will be addressed in this proposal through the generation of tailored stem cell and in vivo mouse models targeting specific TEs, combined with high-throughput sequencing and microscopy.

First, I will investigate the pathogenic threat of TE insertion in mouse embryos during organogenesis. Second, the silencing and activation of TEs during lineage commitment will be addressed in stem-cell-based embryo models. Finally, I will explore the role of TEs in tissue shaping during developmental senescence. This will provide novel insight into unexplored areas of genomic regulation during embryo development. Thereby, TEASEr will introduce TEs as an important player in genetic unsolved congenital malformation and physiological embryogenesis.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants

Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme de financement

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG

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Institution d’accueil

MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSENSCHAFTEN EV
Contribution nette de l'UE

La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.

€ 1 500 328,00
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

€ 1 500 328,00

Bénéficiaires (1)

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