Objectif
This proposal aims to address a critical knowledge gap in understanding phenotypic transitions in the context of chemotherapy resistance. Phenotypic transitions encompass various mechanisms that modify cellular phenotypes over time, including differentiation and metabolic reprogramming, among others. As some cellular phenotypes are transient and chemoresistant cells constitute a rare subpopulation, studying these important phenomena is challenging even with modern, high dimensional phenotyping methods (e.g. proteomics and transcriptomics), as they are intrinsically destructive for the sample and can only provide a single snapshot of these fleeting cellular states.
To overcome this limitation, I propose the development of a groundbreaking framework that combines spatial proteomics with ESPRESSO, a novel omics approach I developed for high-dimensional phenotyping applicable to living system. The resulting ESPRESSO-Omics framework will enable real-time monitoring of both organelle and protein expression profiles in living cells, that will allow us to go back in time and identify the subpopulation with the potential to become chemoresistant, as well as the transitions that lead it there, providing a revolutionary point of view in the identification of therapeutic targets.
Multiple deliverables including an ESPRESSO-Omics atlas, a high-throughput hyperspectral light-sheet microscope and a machine learning framework will be provided during the course of this award, articulated over two work packages (WPs):
WP1: Establishment of the ESPRESSO-omics framework
WP2: Investigation of phenotypic transitions in breast cancer
Understanding phenotypic transitions has broad implications, not only in breast cancer research but also in other cancers and biological systems. The open-source cell atlas, instrumentation specifications and data analysis tools will be valuable resources for the scientific community, democratizing advanced tools for the study of phenotypic transitions
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75654 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.