Descripción del proyecto
El papel de los elementos transponibles en los cambios evolutivos rápidos
La variación en las secuencias del genoma está determinada por cambios estructurales impulsados en gran medida por elementos transponibles (ET), que a menudo tienen efectos funcionales y reproductivos más importantes que las mutaciones puntuales y la recombinación homóloga. Además, esa variación está estrechamente vinculada a la evolución genómica. El proyecto GENELT, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, busca integrar el análisis genómico descendente con estudios mecanísticos ascendentes de la función de los ET. El objetivo es aportar una nueva comprensión de la variación y la evolución de las secuencias genómicas. El equipo de GENELT desarrollará herramientas informáticas avanzadas integradas con métodos experimentales, filogenéticos y de genética de poblaciones. También ampliará los enfoques basados en el «grafo de recombinación ancestral» para incorporar reordenamientos estructurales. Estas herramientas se aplicarán al estudio del aumento de la actividad de ET y de los cambios evolutivos rápidos en dos especies modelo de planta e insecto («Arabidopsis thaliana» y «Drosophila melanogaster»), así como en dos sistemas modelo de vertebrados.
Objetivo
Understanding how genomes work is intimately entangled with understanding how they evolved. Although most individual mutations are single-base, more sequence is changed through structural variation, which itself is in large part driven by transposable elements (TEs), frequently with greater functional and reproductive consequences. Here we will take a multi-pronged and interdisciplinary approach to advance our understanding of how the genomes of multicellular eukaryotes and their TEs co-evolve, building on the near-perfect genome assemblies arriving at an exponentially increasing rate from long-read technologies.
We will develop new efficient computational tools that operate at the scale of the data that is coming, and couple them to powerful population genetic, phylogenetic and experimental approaches to study the dynamics of TE invasions in Arabidopsis and Drosophila, the preeminent systems for genetic analysis of TE-host interactions. We will extend “ancestral recombination graph” approaches beyond current models of point mutation and homologous recombination to also support transposition, non-homologous recombination and other forms of structural rearrangement - this will properly account for these processes in a powerful framework for analysis of selection, population history and trait association. We will then apply these tools to two vertebrate systems, the Malawi cichlid fish radiation and the bats, in both of which increased TE activity is seen alongside rapid evolution with remarkable adaptations to phenotype and lifestyle, and will collaborate with others including those generating large Tree of Life genome datasets.
The resulting advances will connect top-down genomic sequence analysis with bottom-up mechanistic studies of TE function, via population-genetic analysis of demography and selection. This will support the development of a new framework, methodology and understanding of genome sequence variation and genome evolution in all its variety.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por personas.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo.
La clasificación de este proyecto ha sido validada por personas.
Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-SyG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.