Projektbeschreibung
Die Rolle von transposablen Elementen bei schnellen evolutionären Veränderungen
Variationen der Genomsequenz sind von strukturellen Variationen bestimmt, die größtenteils durch transposable Elemente (TE) verursacht werden und oft größere funktionelle und reproduktive Auswirkungen haben als Punktmutationen und homologe Rekombination. Darüber hinaus ist die Sequenzvariation eng mit der genomischen Evolution verbunden. Das ambitionierte ERC-finanzierte Projekt GENELT zielt darauf ab, die Top-down-Analyse von Genomsequenzen mit Bottom-up-Studien der TE-Funktion zu verbinden, um ein neues Licht auf die Genomsequenzvariation und die Evolution zu werfen. GENELT wird fortschrittliche Berechnungsinstrumente entwickeln, die mit leistungsstarken populationsgenetischen, phylogenetischen und experimentellen Ansätzen kombiniert werden. Außerdem werden die Ansätze des „anzestralen Rekombinationsgraphen“ erweitert, um strukturelle Neuanordnungen zu berücksichtigen. Diese Instrumente werden zur Untersuchung der erhöhten TE-Aktivität und der rasanten evolutionären Veränderung in der Modellpflanzengattung Arabidopsis und der Modelltiergattung Drosophila sowie in zwei Wirbeltiersystemen angewandt.
Ziel
Understanding how genomes work is intimately entangled with understanding how they evolved. Although most individual mutations are single-base, more sequence is changed through structural variation, which itself is in large part driven by transposable elements (TEs), frequently with greater functional and reproductive consequences. Here we will take a multi-pronged and interdisciplinary approach to advance our understanding of how the genomes of multicellular eukaryotes and their TEs co-evolve, building on the near-perfect genome assemblies arriving at an exponentially increasing rate from long-read technologies.
We will develop new efficient computational tools that operate at the scale of the data that is coming, and couple them to powerful population genetic, phylogenetic and experimental approaches to study the dynamics of TE invasions in Arabidopsis and Drosophila, the preeminent systems for genetic analysis of TE-host interactions. We will extend “ancestral recombination graph” approaches beyond current models of point mutation and homologous recombination to also support transposition, non-homologous recombination and other forms of structural rearrangement - this will properly account for these processes in a powerful framework for analysis of selection, population history and trait association. We will then apply these tools to two vertebrate systems, the Malawi cichlid fish radiation and the bats, in both of which increased TE activity is seen alongside rapid evolution with remarkable adaptations to phenotype and lifestyle, and will collaborate with others including those generating large Tree of Life genome datasets.
The resulting advances will connect top-down genomic sequence analysis with bottom-up mechanistic studies of TE function, via population-genetic analysis of demography and selection. This will support the development of a new framework, methodology and understanding of genome sequence variation and genome evolution in all its variety.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-SyG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.