Descrizione del progetto
Ruolo degli elementi trasponibili nei cambiamenti evolutivi rapidi
La variazione della sequenza del genoma è dominata dalla variazione strutturale guidata in gran parte da elementi trasponibili e spesso con effetti funzionali e riproduttivi maggiori rispetto alle mutazioni puntiformi e alla ricombinazione omologa. Inoltre, la variazione di sequenza è strettamente legata all’evoluzione genomica. L’ambizioso progetto GENELT, finanziato dal CER, si propone di collegare l’analisi dall'alto verso il basso delle sequenze genomiche con studi meccanici dal basso verso l'alto sulla funzione degli elementi trasponibili per chiarire i meccanismi della variazione della sequenza genomica e dell’evoluzione. GENELT svilupperà strumenti computazionali avanzati integrati con potenti approcci genetici di popolazione, filogenetici e sperimentali. Inoltre, estenderà gli approcci del "grafo di ricombinazione ancestrale" per incorporare i riarrangiamenti strutturali. Questi strumenti saranno applicati per studiare l’intensificazione dell’attività degli elementi trasponibili e il cambiamento evolutivo rapido nei generi di piante e animali modello, Arabidopsis e Drosophila, e in due sistemi di vertebrati.
Obiettivo
Understanding how genomes work is intimately entangled with understanding how they evolved. Although most individual mutations are single-base, more sequence is changed through structural variation, which itself is in large part driven by transposable elements (TEs), frequently with greater functional and reproductive consequences. Here we will take a multi-pronged and interdisciplinary approach to advance our understanding of how the genomes of multicellular eukaryotes and their TEs co-evolve, building on the near-perfect genome assemblies arriving at an exponentially increasing rate from long-read technologies.
We will develop new efficient computational tools that operate at the scale of the data that is coming, and couple them to powerful population genetic, phylogenetic and experimental approaches to study the dynamics of TE invasions in Arabidopsis and Drosophila, the preeminent systems for genetic analysis of TE-host interactions. We will extend “ancestral recombination graph” approaches beyond current models of point mutation and homologous recombination to also support transposition, non-homologous recombination and other forms of structural rearrangement - this will properly account for these processes in a powerful framework for analysis of selection, population history and trait association. We will then apply these tools to two vertebrate systems, the Malawi cichlid fish radiation and the bats, in both of which increased TE activity is seen alongside rapid evolution with remarkable adaptations to phenotype and lifestyle, and will collaborate with others including those generating large Tree of Life genome datasets.
The resulting advances will connect top-down genomic sequence analysis with bottom-up mechanistic studies of TE function, via population-genetic analysis of demography and selection. This will support the development of a new framework, methodology and understanding of genome sequence variation and genome evolution in all its variety.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-SyG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.