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Tracing and harnessing the ancestry of RNA-guided nucleases

Projektbeschreibung

Einblick in die Entwicklung moderner Genomeditierungswerkzeuge

Mit der Genomeditierung wurden Fortschritte in Biologie und Medizin erreicht, denn RNA-gesteuerte Nukleasen konnten nun genutzt werden, um präzise Schnitte in der DNS vorzunehmen. Obwohl diese Proteine in der Natur eine beträchtliche Vielfalt aufweisen, ist über ihre Evolution aus gemeinsamen Vorfahren immer noch wenig bekannt. Die Aufklärung ihrer Ursprünge könnte verborgene funktionelle Eigenschaften zutage fördern, die im Zuge der Spezialisierung verloren gegangen sind, was sich erheblich auf die Entwicklung verbesserter biotechnologischer Werkzeuge auswirken könnte. Das Team des ERC-finanzierten Projekts RGNcestry verfolgt das Ziel, die evolutionären Wege zu untersuchen, aus denen die heutigen CRISPR-Systeme hervorgegangen sind. Anhand der Charakterisierung der biochemischen Eigenschaften und strukturellen Merkmale rekonstruierter Vorfahren wird ermittelt, ob diese Vorfahren über ein breiteres Funktionsspektrum verfügen. Die Projektergebnisse könnten zur Konzipierung von Genomeditierungs- und Diagnostikwerkzeugen der nächsten Generation führen.

Ziel

The phylogenetic, biochemical and functional diversity of these linked RGNs suggest a common origin that gave rise to the innumerable variations we observe today. However, little is known about these ancestors and the evolutionary paths that led to their modern counterparts. Recently, our team showed that reconstructed ancestors of Cas9 and Cas12a RGNs exhibit flexible substrate recognition and collateral activities distinct from any modern counterpart. This work sets the stage to uncover the evolutionary trajectories that gave rise to all related RGNs and to translate insights into new and improved biomolecular tools. As part of RGNcestry, we assembled four accomplished PIs covering CRISPR/transposon biology and technologies, ancestral sequence reconstruction and structural biology. The ensuing project will test our working hypothesis that ancestral RGNs consistently exhibit flexible properties that allow them to function in roles paralleling their modern counterparts, albeit less effectively due to a lack of specialization. To test this hypothesis and translate the resulting discoveries, we will pursue four objectives:

1. Reconstruct a detailed ancestral tree uniting RuvC-harboring RGNs.
2. Define the properties and functional roles of ancestral RGNs.
3. Explore molecular features and dynamics of ancestral RGNs.
4. Enhance and apply ancestral RGNs.

If successful, our high-risk/high-reward project could reveal how RGNs evolved into the rich diversity observed today and establish a new paradigm for RGN engineering and application spanning genome editing to molecular diagnostics.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Die Klassifikation dieses Projekts wurde von Menschen validiert.

Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-ERC-SYG - HORIZON ERC Synergy Grants

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) ERC-2025-SyG

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Gastgebende Einrichtung

FOUNDATION IMMUNE ENGINEERING FOR GLOBAL CHILD AND ADOLESCENT HEALTH
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 3 563 239,75
Adresse
COPARTNER REVISION , ST ALBAN-ANLAGE 46
4052 BASEL
Schweiz

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Region
Schweiz/Suisse/Svizzera Nordwestschweiz Basel-Stadt
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

€ 3 563 239,75

Begünstigte (4)