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Ultrahigh-throughput exploration of metagenomic sequence space to discover and engineer novel biocatalysts and bioactive compounds

Descrizione del progetto

Il futuro della diversità metagenomica: molecole funzionali dal tesoro della natura

Il DNA metagenomico, ovvero la raccolta di tutto il DNA proveniente da fonti naturali, è una preziosa riserva inutilizzata di molecole funzionali. In questo sforzo si uniscono approcci computazionali e sperimentali intesi a far luce sulla «materia oscura» della natura e a consentirne la comprensione sistematica e la successiva valorizzazione nelle tecnologie verdi. Finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto MetaExplore si propone di formare giovani ricercatori in materia di metodi sperimentali e computazionali innovativi, consentendo loro di esplorare e sfruttare l’immenso potenziale biotecnologico insito nello spazio delle sequenze metagenomiche. L’approccio adottato da MetaExplore permette di colmare il divario tra il laboratorio umido e il lavoro in silico, una sinergia richiesta dai moderni strumenti di innovazione per identificare i proverbiali «aghi» nel pagliaio di informazioni fornite dalla natura, come future soluzioni ad alta efficienza per la biocatalisi, la generazione di energia e le applicazioni sanitarie.

Obiettivo

The objective of MetaExplore is to provide research training for young researchers in novel experimental as well as computational methods to fully exploit the immense biotechnological potential of metagenomic sequence space, with innovative approaches on both fronts. On the experimental side, successful screening of large metagenomic libraries requires ultrahigh-throughput technologies, because low hit rates can frustrate conventional experimental formats. Here microfluidic droplet screening (allowing >10e8 picolitre assays per day, at kHz rates) is used in various formats to derive fundamental insight and achieve valorisation, along with label-free mass-spectrometric screens and liquid handling robots. On the in silico side, unprecedented availability of sequence data (e.g. more than 3 billion ORFs in the database MGnify) and machine learning will provide systematic insights based in sequence interpretation. The combination of sequence-based and functional metagenomics is extraordinarily powerful and our training programme bridges the classical divide between them. These skill sets, together with environmental DNA resources (from polar regions, hot environments, soil, marine & fresh-water and gut libraries) support campaigns to identify useful protein reagents, for green technology applications (e. g. for microplastics degradation, glycobiology or fine chemical synthesis), and healthcare (e.g. as bacteriocidal reagents or therapeutic enzymes). 11 leading academic groups and 2 industrial partners will work together in MetaExplore (and 9 companies and universities as associated partners and advisors). The unified efforts of leading stakeholders in the field of metagenomics from Europe will provide a uniquely powerful multidisciplinary training environment with critical mass to facilitate the uptake of new technologies into applied research, exposing young researchers to typical intersectorial challenges in the exploration and sustainable exploitation of biodiversity.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-DN - HORIZON TMA MSCA Doctoral Networks

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2024-DN-01

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 348 738,12
Indirizzo
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (11)

Partner (11)

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