Descripción del proyecto
Cartografía ampliable del microentorno tumoral
La reprogramación epigenética no mutacional y la inestabilidad del genoma son esenciales en el cáncer y están estrechamente relacionadas con el microentorno tumoral. Se necesitan herramientas ampliables, como la ómica espacial, para analizar con eficacia estas relaciones. Las tecnologías actuales carecen de la escalabilidad e interactividad necesarias. Mejorar la cartografía del microentorno tumoral es crucial para comprender la progresión de los tumores e identificar nuevos tratamientos. El equipo del proyecto ScaleMAP, financiado por el Consejo Europeo de Investigación, tiene por objeto crear un conjunto de herramientas para cartografiar la epigenética y la genómica espacial unicelular en los tumores. Esta herramienta permitirá la exploración interactiva en alta resolución de secciones de tejido, de forma similar a Google Maps, y posibilitará el estudio de la evolución del cáncer en tres dimensiones. También desarrollará paquetes analíticos para analizar datos y adaptarlos a muestras clínicas, con aplicaciones que se extenderán a la investigación biológica y la patología digital.
Objetivo
"Nonmutational epigenetic reprogramming and genome instability are hallmarks of cancer, intricately tied to the tumor microenvironment. Understanding these processes requires scalable, spatially resolved tools at the molecular, cellular, and histological levels. The purpose of spatial omics, similar to geographic information systems (GIS), is to enable the analysis of spatial relationships across complex biological features. In GIS, geospatial indexing allows us to effortlessly search for patterns and events—such as Dating Apps, Chat Apps or Proximity searches (Uber, Lyft, Yelp, Google)—using real-time updates and interactive maps. In contrast, current spatial omics technologies lack scalability, real-time integration, and interactive visualization. Scalable mapping of the tumor microenvironment at multiple levels is essential to decipher tumor progression and identify new therapeutic targets. Inspired by geospatial indexing, I will develop an interdisciplinary toolbox, ScaleMAP, for mapping single-cell spatial epigenetics and genomics within the tumor microenvironment. ScaleMAP offers high-throughput, high-resolution, scalable, and interactive mapping across large tissue sections. 3D reconstruction of ScaleMAP will enable the investigation of cancer evolution in three dimensions. Like Google Maps, ScaleMAP treats tissues as ""biological terrains,"" allowing researchers to interactively zoom into specific areas of interest across molecular, cellular, and histological levels to extract valuable insights. We will also develop GIS-inspired analytical packages for ScaleMAP data. Furthermore, we will adapt ScaleMAP for formalin-fixed paraffin-embedded samples and apply it to clinically archived paired primary and metastatic colorectal cancer samples to dissect metastasis. Beyond cancer, ScaleMAP has broad applications in biological research and digital pathology, offering powerful tools for exploration, diagnosis, and therapeutic discovery."
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias de la tierra y ciencias ambientales conexas geografía física cartografía sistemas de información geográfica
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
- ciencias médicas y de la salud medicina básica patología
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética epigenética
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2025-COG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
751 05 Uppsala
Suecia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.