Description du projet
Cartographie évolutive du micro-environnement tumoral
La reprogrammation épigénétique non mutationnelle et l’instabilité du génome sont essentielles dans le cancer et sont étroitement liées au microenvironnement tumoral. Des outils évolutifs, tels que l’omique spatiale, sont nécessaires pour analyser efficacement ces relations. Les technologies actuelles n’offrent pas l’évolutivité et l’interactivité nécessaires. Il est essentiel d’améliorer la cartographie du microenvironnement tumoral pour comprendre la progression des tumeurs et identifier de nouveaux traitements. Le projet ScaleMAP, financé par le CER, va créer une boîte à outils pour cartographier l’épigénétique et la génomique spatiales des cellules uniques dans les tumeurs. Cet outil permettra l’exploration interactive à haute résolution de coupes de tissus, à l’instar de Google Maps, et l’étude de l’évolution du cancer en 3D. Il développera également des progiciels analytiques pour l’analyse des données et l’adaptation aux échantillons cliniques, avec des applications qui s’étendent à la recherche biologique et à la pathologie numérique.
Objectif
"Nonmutational epigenetic reprogramming and genome instability are hallmarks of cancer, intricately tied to the tumor microenvironment. Understanding these processes requires scalable, spatially resolved tools at the molecular, cellular, and histological levels. The purpose of spatial omics, similar to geographic information systems (GIS), is to enable the analysis of spatial relationships across complex biological features. In GIS, geospatial indexing allows us to effortlessly search for patterns and events—such as Dating Apps, Chat Apps or Proximity searches (Uber, Lyft, Yelp, Google)—using real-time updates and interactive maps. In contrast, current spatial omics technologies lack scalability, real-time integration, and interactive visualization. Scalable mapping of the tumor microenvironment at multiple levels is essential to decipher tumor progression and identify new therapeutic targets. Inspired by geospatial indexing, I will develop an interdisciplinary toolbox, ScaleMAP, for mapping single-cell spatial epigenetics and genomics within the tumor microenvironment. ScaleMAP offers high-throughput, high-resolution, scalable, and interactive mapping across large tissue sections. 3D reconstruction of ScaleMAP will enable the investigation of cancer evolution in three dimensions. Like Google Maps, ScaleMAP treats tissues as ""biological terrains,"" allowing researchers to interactively zoom into specific areas of interest across molecular, cellular, and histological levels to extract valuable insights. We will also develop GIS-inspired analytical packages for ScaleMAP data. Furthermore, we will adapt ScaleMAP for formalin-fixed paraffin-embedded samples and apply it to clinically archived paired primary and metastatic colorectal cancer samples to dissect metastasis. Beyond cancer, ScaleMAP has broad applications in biological research and digital pathology, offering powerful tools for exploration, diagnosis, and therapeutic discovery."
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géographie physique cartographie systèmes d’information géographique
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pathologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique épigénétique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2025-COG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
751 05 Uppsala
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.