Opis projektu
Mapowanie mikrośrodowiska guza w różnych skalach
Niemutujące przeprogramowanie epigenetyczne i niestabilność genomu mają zasadnicze znaczenie w przypadku nowotworów i są ściśle powiązane z mikrośrodowiskiem guza. Do skutecznej analizy tych zależności potrzebne są skalowalne narzędzia, w tym przestrzenne technologie omiczne. Obecne techniki nie mają jednak wymaganej skalowalności i interaktywności. Poprawa mapowania mikrośrodowiska guza jest niezbędna do zrozumienia progresji nowotworu i identyfikacji nowych metod leczenia. Finansowany przez ERBN projekt ScaleMAP zakłada stworzenie zestawu narzędzi do mapowania przestrzennej epigenetyki i genomiki pojedynczych komórek w nowotworach. Narzędzie to pozwoli na interaktywną eksplorację wycinków tkanek w wysokiej rozdzielczości, podobnie jak Mapy Google, i umożliwi badanie ewolucji raka w trzech wymiarach. Zespół opracuje również pakiety analityczne do analizy danych i adaptacji do próbek klinicznych, których zastosowania obejmą badania biologiczne i patologię cyfrową.
Cel
"Nonmutational epigenetic reprogramming and genome instability are hallmarks of cancer, intricately tied to the tumor microenvironment. Understanding these processes requires scalable, spatially resolved tools at the molecular, cellular, and histological levels. The purpose of spatial omics, similar to geographic information systems (GIS), is to enable the analysis of spatial relationships across complex biological features. In GIS, geospatial indexing allows us to effortlessly search for patterns and events—such as Dating Apps, Chat Apps or Proximity searches (Uber, Lyft, Yelp, Google)—using real-time updates and interactive maps. In contrast, current spatial omics technologies lack scalability, real-time integration, and interactive visualization. Scalable mapping of the tumor microenvironment at multiple levels is essential to decipher tumor progression and identify new therapeutic targets. Inspired by geospatial indexing, I will develop an interdisciplinary toolbox, ScaleMAP, for mapping single-cell spatial epigenetics and genomics within the tumor microenvironment. ScaleMAP offers high-throughput, high-resolution, scalable, and interactive mapping across large tissue sections. 3D reconstruction of ScaleMAP will enable the investigation of cancer evolution in three dimensions. Like Google Maps, ScaleMAP treats tissues as ""biological terrains,"" allowing researchers to interactively zoom into specific areas of interest across molecular, cellular, and histological levels to extract valuable insights. We will also develop GIS-inspired analytical packages for ScaleMAP data. Furthermore, we will adapt ScaleMAP for formalin-fixed paraffin-embedded samples and apply it to clinically archived paired primary and metastatic colorectal cancer samples to dissect metastasis. Beyond cancer, ScaleMAP has broad applications in biological research and digital pathology, offering powerful tools for exploration, diagnosis, and therapeutic discovery."
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki o Ziemi i pokrewne nauki o środowisku geografia fizyczna kartografia systemy informacji geograficznej
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna onkologia
- medycyna i nauki o zdrowiu medycyna kliniczna patologia
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka epigenetyka
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) ERC-2025-COG
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaInstytucja przyjmująca
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
751 05 Uppsala
Szwecja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.