Descrizione del progetto
Decifrare il codice dell’efficacia dei batteriofagi
I batteriofagi, virus parassiti che infettano e uccidono i batteri, stanno suscitando sempre più interesse in qualità di strumenti di precisione contro le infezioni resistenti agli antibiotici e al fine di rimodellare il microbioma. Affinché sia possibile liberarne il potenziale, gli scienziati necessitano di una migliore comprensione degli effetti della fisiologia dell’organismo ospitante batterico sull’infezione e sulla sua progressione, compresi gli effetti della variabilità delle sottopopolazioni tra le cellule batteriche. Il progetto PHYSIOPHAGE, finanziato dal CER, si propone di affrontare questo problema attraverso la modellizzazione basata sui dati e la sperimentazione utilizzando tecniche pionieristiche di imaging a singola cellula, insieme a una piattaforma che integra le risposte dei batteriofagi a livello di singola cellula con le dinamiche a livello di popolazione. Rivelando le modalità attraverso cui il metabolismo dell’organismo ospitante e le risposte allo stress, la variabilità delle cellule di questo organismo e il suo microambiente modulano le dinamiche dell’infezione fagica, i risultati di PHYSIOPHAGE potrebbero consentire la progettazione razionale dei fagi come strumenti di precisione contro la resistenza agli antibiotici e per la modulazione del microbioma.
Obiettivo
Bacteriophages (phages) are viruses that infect and kill bacteria, playing a crucial role in shaping microbial communities. They are also emerging as precision tools for combating antibiotic-resistant bacteria, targeted biocontrol, and microbiome modulation.
As obligate parasites, phages rely on the physiological state of their bacterial hosts to progress through infection stages. However, the mechanisms by which host physiology affects the success of phage infection within cells and how host variability impacts phage effectiveness in eradicating bacterial populations remain poorly understood. This knowledge gap limits our ability to predict phage performance across environments and engineer them for reliable use.
Progress has been hindered by the lack of tools to link host cell physiology to phage infection dynamics and to connect single-cell variability to population-level outcomes. To address this, we have developed innovative methodologies, including a high-throughput imaging system for real-time tracking of phage infection progression within individual infected cells and the microCOSM platform, which integrates single-cell responses with population-level dynamics. Using these systems, combined with data-driven models and model-guided experiments, we will address three key questions:
How do host physiological factors, such as metabolism and stress responses, govern phage infection success and progression at the single-cell level?
How does variability in host cell physiology shape phage efficacy at the population level, and when do phage-tolerant subpopulations emerge?
How do changes in the physical and biochemical nature of the host’s environment affect phage efficacy and how can we leverage physiological perturbations to steer infection outcome?
This study will uncover the physiological determinants of phage efficacy and phage tolerance, enabling the design of phages as precise, reliable tools for combating antibiotic resistance and modulating microbiomes.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
La classificazione di questo progetto è stata convalidata da un essere umano.
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia batteriologia
- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze mediche e della salute scienze della salute parassitologia
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione scienze computazionali
- scienze mediche e della salute medicina di base farmacologia e farmacia farmacoresistenza resistenza agli antibiotici
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMMA PRINCIPALE
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) ERC-2025-COG
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
CB2 1TN CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.